39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3156 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  100 
 
 		 197 aa  377  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  36.11 
 
 		 166 aa  84.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  32.97 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  32.97 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  27.89 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  32.12 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  30.51 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  31.69 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  31.52 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  27.07 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  26.46 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  28.11 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  31.55 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  31.55 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  29.26 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  29.51 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  31.15 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  28.8 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  28.26 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  31.35 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  27.72 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  29.03 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  27.32 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  30.43 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  26.52 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  28.14 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  26.6 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  29.83 
 
 		 165 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  26.02 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  26.02 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  28.25 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  27.17 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  26.32 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  25 
 
 		 163 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  25 
 
 		 163 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  24.58 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  29.52 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5424  hypothetical protein  33.75 
 
 		 154 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0828804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>