44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3072 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  333  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  80.13 
 
 		 168 aa  263  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  58.02 
 
 		 163 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  58.02 
 
 		 163 aa  188  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  56.17 
 
 		 163 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  60.49 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  55.21 
 
 		 249 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  52.44 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  59.26 
 
 		 163 aa  154  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  36.75 
 
 		 172 aa  133  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  43.4 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  38.99 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  35.03 
 
 		 163 aa  100  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  33.54 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  33.54 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  34.73 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  32.93 
 
 		 176 aa  94  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  41.94 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  38.37 
 
 		 182 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  35.76 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  37.79 
 
 		 202 aa  89  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  34.59 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  34.59 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  37.21 
 
 		 232 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  37.97 
 
 		 166 aa  84.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  30.13 
 
 		 301 aa  84.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  34.29 
 
 		 175 aa  84  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  38.41 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  35.19 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  32.92 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  35.9 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  34.34 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  39.66 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  33.96 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  38.36 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  38.31 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  31.14 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  32.12 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  29.63 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  31.74 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  34.07 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  35.22 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  39.1 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  25.53 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>