48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0077 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  350  5e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  73.81 
 
 		 170 aa  211  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  73.37 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  63.64 
 
 		 173 aa  207  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  63.86 
 
 		 175 aa  200  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  56.82 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  60.34 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  60.34 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  53.76 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  60.45 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  58.24 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  50 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  50 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  51.5 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  44.05 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  44.05 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  52.66 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  46.93 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  50.64 
 
 		 193 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  50.62 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  45.93 
 
 		 169 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  45.24 
 
 		 301 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  42.07 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  42.07 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  45.6 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  38.51 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  49.39 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  36.36 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  39.88 
 
 		 163 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  49.09 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  36.84 
 
 		 167 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  43.71 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  39.02 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  46.99 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  34.73 
 
 		 163 aa  96.7  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  34.32 
 
 		 148 aa  88.6  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  48.42 
 
 		 91 aa  84.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  39.44 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  40.94 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  30.37 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  35.93 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  37.5 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  37.28 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  72.97 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  30.46 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0771  membrane protein of uknown function UCP014873  33.03 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  27.78 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>