47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0656 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  362  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  60.12 
 
 		 202 aa  195  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  59.52 
 
 		 232 aa  193  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  62.58 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  54.94 
 
 		 173 aa  174  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  48.19 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  49.71 
 
 		 175 aa  162  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  53.76 
 
 		 179 aa  157  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  52.98 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  48.8 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  45 
 
 		 172 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  46.3 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  40.12 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  40.12 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  42.33 
 
 		 301 aa  124  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  37.02 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  37.02 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  41.42 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  47.53 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  40.96 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  40.96 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  42.95 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  34.09 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  42.33 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3072  hypothetical protein  38.95 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  38.2 
 
 		 172 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2210  hypothetical protein  41.82 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  39.88 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  36.75 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  35.29 
 
 		 163 aa  99.4  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  34.94 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2312  hypothetical protein  42.94 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0906747  normal  0.167452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1980  hypothetical protein  32.72 
 
 		 172 aa  93.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.426393  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  44.58 
 
 		 173 aa  91.7  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  91.3  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3069  hypothetical protein  35.58 
 
 		 168 aa  89  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.17224  normal  0.666956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4566  membrane protein of uknown function UCP014873  36.78 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  41.05 
 
 		 91 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1527  membrane protein of uknown function UCP014873  35.12 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.816437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0758  membrane protein of uknown function UCP014873  38.46 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0759  membrane protein of uknown function UCP014873  35.09 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  24.49 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1820  membrane protein of uknown function UCP014873  28.65 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0164172  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  33.54 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4067  membrane protein of uknown function UCP014873  28.07 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.527907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  59.46 
 
 		 56 aa  48.5  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>