19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3602 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  100 
 
 
174 aa  344  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  31.93 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  30.06 
 
 
166 aa  54.3  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  29.1 
 
 
179 aa  51.2  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  28.9 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  28.81 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  25.61 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  26.29 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  31.74 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  29.59 
 
 
166 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  29.59 
 
 
166 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  26.74 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  25 
 
 
232 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  30.67 
 
 
170 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  27.78 
 
 
301 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  23.91 
 
 
202 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4002  hypothetical protein  27.33 
 
 
148 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  26.67 
 
 
174 aa  40.8  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>