More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2193 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1144  hypothetical protein  43.7 
 
 
924 aa  737    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2053  membrane alanine aminopeptidase  55.78 
 
 
956 aa  1103    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.367817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0032  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  55.4 
 
 
940 aa  1066    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2193  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
952 aa  1944    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0739  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  35.56 
 
 
887 aa  502  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207959  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0774  aminopeptidase N  26.42 
 
 
883 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1314  aminopeptidase N  25.58 
 
 
883 aa  208  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.542169  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0445  aminopeptidase N  24.95 
 
 
878 aa  199  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1741  aminopeptidase N  25.08 
 
 
901 aa  199  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00168597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2017  aminopeptidase N  25.38 
 
 
885 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.981665  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1577  aminopeptidase N  25.85 
 
 
885 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.255271  normal  0.230076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3725  aminopeptidase N  25.16 
 
 
885 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0304  aminopeptidase N  25.75 
 
 
877 aa  194  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1549  aminopeptidase N  24.95 
 
 
885 aa  194  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.482315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1737  aminopeptidase N  24.15 
 
 
890 aa  191  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3430  aminopeptidase N  24.77 
 
 
863 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42212  normal  0.288078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0850  aminopeptidase N  24.77 
 
 
885 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1787  aminopeptidase N  24.41 
 
 
871 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00859776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2060  aminopeptidase N  24.53 
 
 
871 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1996  aminopeptidase N  22.91 
 
 
874 aa  185  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0466032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2067  aminopeptidase N  25.45 
 
 
880 aa  186  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1669  aminopeptidase N  25.19 
 
 
871 aa  183  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0744624  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1223  aminopeptidase N  24.86 
 
 
851 aa  181  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.336507 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2662  aminopeptidase N  23.92 
 
 
883 aa  178  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2368  aminopeptidase N  25.74 
 
 
874 aa  178  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0957  aminopeptidase N  24.49 
 
 
878 aa  178  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1034  aminopeptidase N  24.89 
 
 
876 aa  177  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2200  aminopeptidase N  24.73 
 
 
885 aa  177  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.94331  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2201  aminopeptidase N  23.99 
 
 
849 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1690  aminopeptidase N  24.73 
 
 
888 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.325147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0120  aminopeptidase N  26.93 
 
 
903 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2559  aminopeptidase N  23.72 
 
 
849 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.841322  normal  0.125353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1734  aminopeptidase N  24.08 
 
 
871 aa  174  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.357602  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1905  aminopeptidase N  23.61 
 
 
849 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136022  normal  0.25158 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2439  aminopeptidase N  23.38 
 
 
849 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.385207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0253  aminopeptidase N  24.32 
 
 
880 aa  172  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1374  aminopeptidase N  25.08 
 
 
892 aa  172  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1015  aminopeptidase N  24.42 
 
 
870 aa  172  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000603521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1919  aminopeptidase N  25.35 
 
 
885 aa  172  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.280956  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1132  aminopeptidase N  24.42 
 
 
870 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195305  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1166  aminopeptidase N  24.53 
 
 
870 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322858  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1098  aminopeptidase N  24.42 
 
 
870 aa  171  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.100576  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003433  membrane alanine aminopeptidase N  23.69 
 
 
868 aa  171  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00936  aminopeptidase N  24.83 
 
 
870 aa  170  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00647733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2711  aminopeptidase N  24.83 
 
 
870 aa  170  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1041  aminopeptidase N  24.83 
 
 
870 aa  170  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.230058  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2521  aminopeptidase N  24.89 
 
 
879 aa  170  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00943  hypothetical protein  24.83 
 
 
870 aa  170  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00550422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1094  aminopeptidase N  24.83 
 
 
870 aa  170  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0163604  normal  0.415463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2446  aminopeptidase N  23.5 
 
 
849 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2664  aminopeptidase N  24.83 
 
 
870 aa  169  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00436618  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1723  aminopeptidase N  22.99 
 
 
852 aa  169  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1982  aminopeptidase N  24.08 
 
 
871 aa  169  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.100486  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2556  aminopeptidase N  24.16 
 
 
871 aa  169  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0655093  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2104  aminopeptidase N  26.97 
 
 
887 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0562697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1119  aminopeptidase N  24.48 
 
 
870 aa  169  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2645  aminopeptidase N  24.08 
 
 
871 aa  169  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142802  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1033  aminopeptidase N  24.72 
 
 
870 aa  168  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00218696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2386  aminopeptidase N  24.61 
 
 
870 aa  168  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0617  aminopeptidase N  24.14 
 
 
883 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0513  aminopeptidase N  26.36 
 
 
878 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4749  aminopeptidase N  24.71 
 
 
876 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2187  aminopeptidase N  24.83 
 
 
870 aa  167  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.739046 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0268  aminopeptidase N  24.22 
 
 
880 aa  167  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2600  aminopeptidase N  23.41 
 
 
849 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1803  aminopeptidase N  23.91 
 
 
853 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0680327  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2265  aminopeptidase N  24.51 
 
 
900 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129158  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2167  aminopeptidase N  23.52 
 
 
877 aa  167  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268834 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0884  aminopeptidase N  24.21 
 
 
869 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0859653  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18730  aminopeptidase N  24.95 
 
 
885 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.615825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2055  aminopeptidase N  25.39 
 
 
885 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194007  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0439  aminopeptidase N  22.59 
 
 
875 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.956932  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0906  aminopeptidase N  24.27 
 
 
881 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0616  aminopeptidase N  23.92 
 
 
883 aa  165  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24270  aminopeptidase N  25.43 
 
 
885 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.626767  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0194  aminopeptidase N  24.58 
 
 
888 aa  164  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1749  aminopeptidase N  23.3 
 
 
849 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0219335  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1102  aminopeptidase N  23.36 
 
 
868 aa  164  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3788  aminopeptidase N  23.65 
 
 
888 aa  163  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1942  aminopeptidase N  24.1 
 
 
900 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0574258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1674  aminopeptidase N  23.19 
 
 
849 aa  163  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300975  normal  0.663884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2134  aminopeptidase N  22.52 
 
 
859 aa  162  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.258257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1451  aminopeptidase N  23.79 
 
 
870 aa  162  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1586  aminopeptidase N  24.78 
 
 
852 aa  161  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109191  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3676  aminopeptidase N  25.81 
 
 
868 aa  160  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0620  aminopeptidase N  21.39 
 
 
852 aa  159  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02344  aminopeptidase N  23.33 
 
 
868 aa  159  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0930  aminopeptidase N  24.77 
 
 
882 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.182731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0923  aminopeptidase N  24.2 
 
 
898 aa  158  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3068  aminopeptidase N  24.6 
 
 
898 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02005  aminopeptidase N  22.83 
 
 
869 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2482  aminopeptidase N  22.32 
 
 
855 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279976  hitchhiker  0.00729308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1592  aminopeptidase N  25.86 
 
 
881 aa  156  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491814  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2939  aminopeptidase N  23.67 
 
 
885 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0383897  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2344  aminopeptidase N  22.96 
 
 
880 aa  155  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2227  aminopeptidase N  22.8 
 
 
853 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.396627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0267  aminopeptidase N  26.25 
 
 
894 aa  155  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341125  normal  0.0226017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1779  aminopeptidase N  23.16 
 
 
849 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0345573 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1548  aminopeptidase N  23.49 
 
 
875 aa  153  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1238  aminopeptidase N  23.49 
 
 
871 aa  154  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>