More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1548 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1803  aminopeptidase N  45.49 
 
 		 853 aa  732    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0680327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36617  predicted protein  45.95 
 
 		 884 aa  767    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000615494  hitchhiker  0.0024222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00936  aminopeptidase N  48.9 
 
 		 870 aa  800    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00647733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2711  aminopeptidase N  48.9 
 
 		 870 aa  800    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2446  aminopeptidase N  43.85 
 
 		 849 aa  703    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0304  aminopeptidase N  47.64 
 
 		 877 aa  778    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2017  aminopeptidase N  49.6 
 
 		 885 aa  824    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.981665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0774  aminopeptidase N  51.37 
 
 		 883 aa  838    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2125  aminopeptidase N  49.5 
 
 		 905 aa  790    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2808  aminopeptidase N  44.46 
 
 		 872 aa  712    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0161  aminopeptidase N  49 
 
 		 900 aa  772    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0617  aminopeptidase N  46.82 
 
 		 883 aa  739    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3081  aminopeptidase N  47.26 
 
 		 851 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2600  aminopeptidase N  44.38 
 
 		 849 aa  704    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3788  aminopeptidase N  49.61 
 
 		 888 aa  830    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0466  aminopeptidase N  49 
 
 		 900 aa  772    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2662  aminopeptidase N  48.08 
 
 		 883 aa  761    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2855  aminopeptidase N  49.94 
 
 		 865 aa  806    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2556  aminopeptidase N  48.67 
 
 		 871 aa  780    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0655093  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2724  aminopeptidase N  50.06 
 
 		 865 aa  806    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2774  aminopeptidase N  46.54 
 
 		 898 aa  705    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1690  aminopeptidase N  48.32 
 
 		 888 aa  816    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.325147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0909  aminopeptidase N  43.84 
 
 		 882 aa  679    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.998787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3676  aminopeptidase N  48.85 
 
 		 868 aa  778    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1451  aminopeptidase N  48.55 
 
 		 870 aa  792    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2443  aminopeptidase N  49.61 
 
 		 899 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2055  aminopeptidase N  51.48 
 
 		 885 aa  829    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194007  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0899  aminopeptidase N  46.97 
 
 		 925 aa  754    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570947  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19807  predicted protein  44.84 
 
 		 869 aa  728    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137348  normal  0.504611 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3028  aminopeptidase N  49 
 
 		 957 aa  774    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1314  aminopeptidase N  50.29 
 
 		 883 aa  867    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.542169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2200  aminopeptidase N  48.81 
 
 		 885 aa  812    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.94331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1982  aminopeptidase N  48.8 
 
 		 851 aa  717    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1649  aminopeptidase N  48.3 
 
 		 888 aa  806    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00465635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4126  aminopeptidase N  49.94 
 
 		 897 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352628  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0754  aminopeptidase N  45.2 
 
 		 867 aa  662    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1912  aminopeptidase N  45.58 
 
 		 867 aa  671    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1485  aminopeptidase N  44.57 
 
 		 884 aa  730    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.388808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0620  aminopeptidase N  41.13 
 
 		 852 aa  653    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1741  aminopeptidase N  45.01 
 
 		 901 aa  762    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00168597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2939  aminopeptidase N  50.95 
 
 		 885 aa  839    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0383897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1608  aminopeptidase N  47.62 
 
 		 919 aa  744    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3725  aminopeptidase N  49.94 
 
 		 885 aa  826    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10001  aminopeptidase N  42.63 
 
 		 872 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.458523 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02344  aminopeptidase N  46.14 
 
 		 868 aa  772    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2344  aminopeptidase N  46.34 
 
 		 880 aa  756    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3270  aminopeptidase N  47.47 
 
 		 871 aa  736    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1872  aminopeptidase N  47.48 
 
 		 856 aa  719    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.802085  normal  0.0348851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2703  aminopeptidase N  47.66 
 
 		 904 aa  771    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1068  aminopeptidase N  46.59 
 
 		 915 aa  750    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1737  aminopeptidase N  48.32 
 
 		 890 aa  843    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1238  aminopeptidase N  47.54 
 
 		 871 aa  761    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1587  aminopeptidase N  47.1 
 
 		 906 aa  757    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0923  aminopeptidase N  48.27 
 
 		 898 aa  784    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1723  aminopeptidase N  43.28 
 
 		 852 aa  714    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148717  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0920  aminopeptidase N  41.97 
 
 		 863 aa  638    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0642  aminopeptidase N  46.47 
 
 		 884 aa  733    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411291  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2521  aminopeptidase N  48.41 
 
 		 879 aa  769    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1508  aminopeptidase N  44.31 
 
 		 880 aa  694    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.112565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0876  aminopeptidase N  49.61 
 
 		 897 aa  799    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2201  aminopeptidase N  43.16 
 
 		 849 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0706  aminopeptidase N  45.67 
 
 		 854 aa  708    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.281728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0475  aminopeptidase N  48.44 
 
 		 864 aa  763    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.392595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0536  aminopeptidase N  50 
 
 		 897 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4749  aminopeptidase N  50.46 
 
 		 876 aa  814    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1041  aminopeptidase N  48.9 
 
 		 870 aa  800    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.230058  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1996  aminopeptidase N  44.11 
 
 		 874 aa  719    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0466032  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0120  aminopeptidase N  51.48 
 
 		 903 aa  826    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0906  aminopeptidase N  46.52 
 
 		 881 aa  747    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0884  aminopeptidase N  45.28 
 
 		 869 aa  737    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0859653  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0668  aminopeptidase N  48.47 
 
 		 869 aa  785    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1674  aminopeptidase N  44.68 
 
 		 849 aa  708    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300975  normal  0.663884 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2614  aminopeptidase N  49 
 
 		 900 aa  772    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0439  aminopeptidase N  46 
 
 		 875 aa  780    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.956932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1749  aminopeptidase N  44.91 
 
 		 849 aa  708    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0219335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1592  aminopeptidase N  53.39 
 
 		 881 aa  840    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2227  aminopeptidase N  43.48 
 
 		 853 aa  700    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.396627  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2759  aminopeptidase N  46.66 
 
 		 900 aa  737    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0878  aminopeptidase N  49.56 
 
 		 897 aa  774    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24270  aminopeptidase N  51.25 
 
 		 885 aa  827    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.626767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0986  aminopeptidase N  49 
 
 		 900 aa  772    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2922  aminopeptidase N  49 
 
 		 900 aa  772    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0957  aminopeptidase N  49.66 
 
 		 878 aa  842    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0692  aminopeptidase N  48.69 
 
 		 882 aa  718    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625099  normal  0.73925 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0616  aminopeptidase N  46.7 
 
 		 883 aa  739    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1102  aminopeptidase N  46.88 
 
 		 868 aa  779    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2983  aminopeptidase N  49 
 
 		 900 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1015  aminopeptidase N  50 
 
 		 897 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2439  aminopeptidase N  43.97 
 
 		 849 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.385207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1919  aminopeptidase N  48.17 
 
 		 885 aa  753    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.280956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1150  aminopeptidase N  47.1 
 
 		 926 aa  759    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1779  aminopeptidase N  44.9 
 
 		 849 aa  707    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0345573 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4053  aminopeptidase N  46.18 
 
 		 847 aa  702    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2167  aminopeptidase N  46.86 
 
 		 877 aa  793    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2067  aminopeptidase N  48.41 
 
 		 880 aa  794    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149086  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26022  predicted protein  43.41 
 
 		 924 aa  662    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.812469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2104  aminopeptidase N  48.97 
 
 		 887 aa  752    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0562697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1586  aminopeptidase N  44.03 
 
 		 852 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1844  aminopeptidase N  48.12 
 
 		 903 aa  763    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2754  aminopeptidase N  48.61 
 
 		 865 aa  801    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>