More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2200 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2614  aminopeptidase N  49.28 
 
 
900 aa  837    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2983  aminopeptidase N  49.39 
 
 
900 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3081  aminopeptidase N  47.73 
 
 
851 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00936  aminopeptidase N  49.83 
 
 
870 aa  856    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00647733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2711  aminopeptidase N  49.83 
 
 
870 aa  856    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2167  aminopeptidase N  56.24 
 
 
877 aa  1013    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0304  aminopeptidase N  49.94 
 
 
877 aa  889    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2017  aminopeptidase N  85.42 
 
 
885 aa  1600    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.981665  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0774  aminopeptidase N  55.58 
 
 
883 aa  997    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2125  aminopeptidase N  51.53 
 
 
905 aa  871    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2808  aminopeptidase N  45.97 
 
 
872 aa  773    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1803  aminopeptidase N  48.98 
 
 
853 aa  837    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0680327  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0617  aminopeptidase N  45.02 
 
 
883 aa  751    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0986  aminopeptidase N  49.28 
 
 
900 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2600  aminopeptidase N  46.61 
 
 
849 aa  800    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3788  aminopeptidase N  86.58 
 
 
888 aa  1621    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0466  aminopeptidase N  49.28 
 
 
900 aa  837    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2662  aminopeptidase N  46.46 
 
 
883 aa  779    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2855  aminopeptidase N  50.68 
 
 
865 aa  868    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2556  aminopeptidase N  50.68 
 
 
871 aa  869    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0655093  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2724  aminopeptidase N  50.8 
 
 
865 aa  866    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2201  aminopeptidase N  46.21 
 
 
849 aa  795    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1690  aminopeptidase N  86.92 
 
 
888 aa  1628    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.325147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0909  aminopeptidase N  43.66 
 
 
882 aa  673    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.998787  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3676  aminopeptidase N  49.83 
 
 
868 aa  865    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26022  predicted protein  46.65 
 
 
924 aa  793    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.812469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1041  aminopeptidase N  49.83 
 
 
870 aa  856    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.230058  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2443  aminopeptidase N  50.55 
 
 
899 aa  875    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0642  aminopeptidase N  45.86 
 
 
884 aa  761    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411291  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0899  aminopeptidase N  48.28 
 
 
925 aa  846    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570947  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0668  aminopeptidase N  47.05 
 
 
869 aa  771    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3028  aminopeptidase N  49.5 
 
 
957 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1314  aminopeptidase N  53.91 
 
 
883 aa  1007    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.542169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2200  aminopeptidase N  100 
 
 
885 aa  1843    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.94331  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1982  aminopeptidase N  47.9 
 
 
851 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1649  aminopeptidase N  48.14 
 
 
888 aa  858    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00465635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4126  aminopeptidase N  50 
 
 
897 aa  850    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352628  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0754  aminopeptidase N  41.86 
 
 
867 aa  639    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2482  aminopeptidase N  47.04 
 
 
855 aa  812    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279976  hitchhiker  0.00729308 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1485  aminopeptidase N  46.23 
 
 
884 aa  801    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.388808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0620  aminopeptidase N  44.41 
 
 
852 aa  743    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1741  aminopeptidase N  49.6 
 
 
901 aa  898    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00168597  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2754  aminopeptidase N  48.53 
 
 
865 aa  811    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1608  aminopeptidase N  49.72 
 
 
919 aa  820    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2939  aminopeptidase N  83.73 
 
 
885 aa  1548    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0383897  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3270  aminopeptidase N  47.58 
 
 
871 aa  777    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1872  aminopeptidase N  45.52 
 
 
856 aa  704    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.802085  normal  0.0348851 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2703  aminopeptidase N  48.33 
 
 
904 aa  811    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36617  predicted protein  51.13 
 
 
884 aa  883    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000615494  hitchhiker  0.0024222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1737  aminopeptidase N  56.79 
 
 
890 aa  1033    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1238  aminopeptidase N  49.49 
 
 
871 aa  825    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1587  aminopeptidase N  48.61 
 
 
906 aa  811    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0923  aminopeptidase N  50.5 
 
 
898 aa  857    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1723  aminopeptidase N  46.83 
 
 
852 aa  802    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148717  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1844  aminopeptidase N  48.08 
 
 
903 aa  790    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2055  aminopeptidase N  81.36 
 
 
885 aa  1512    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2521  aminopeptidase N  57.13 
 
 
879 aa  1011    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1508  aminopeptidase N  43.88 
 
 
880 aa  681    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.112565  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0876  aminopeptidase N  50.88 
 
 
897 aa  886    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2104  aminopeptidase N  48.23 
 
 
887 aa  813    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0562697  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0706  aminopeptidase N  47.52 
 
 
854 aa  774    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.281728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0475  aminopeptidase N  48.42 
 
 
864 aa  794    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.392595  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0536  aminopeptidase N  50 
 
 
897 aa  842    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1068  aminopeptidase N  48.24 
 
 
915 aa  808    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0161  aminopeptidase N  49.28 
 
 
900 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1996  aminopeptidase N  45.93 
 
 
874 aa  793    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0466032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0906  aminopeptidase N  46.46 
 
 
881 aa  782    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1102  aminopeptidase N  48.92 
 
 
868 aa  851    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0884  aminopeptidase N  46.89 
 
 
869 aa  806    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0859653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3725  aminopeptidase N  85.65 
 
 
885 aa  1603    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1674  aminopeptidase N  47.29 
 
 
849 aa  818    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0300975  normal  0.663884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02344  aminopeptidase N  48.98 
 
 
868 aa  858    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0957  aminopeptidase N  52.2 
 
 
878 aa  932    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1749  aminopeptidase N  47.74 
 
 
849 aa  825    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0219335  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1592  aminopeptidase N  51.13 
 
 
881 aa  865    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491814  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2227  aminopeptidase N  46.21 
 
 
853 aa  776    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.396627  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0120  aminopeptidase N  50.73 
 
 
903 aa  869    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0878  aminopeptidase N  49.94 
 
 
897 aa  840    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24270  aminopeptidase N  81.47 
 
 
885 aa  1512    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.626767  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2774  aminopeptidase N  45.7 
 
 
898 aa  729    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2922  aminopeptidase N  49.5 
 
 
900 aa  839    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0692  aminopeptidase N  48.02 
 
 
882 aa  737    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625099  normal  0.73925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2446  aminopeptidase N  46.26 
 
 
849 aa  799    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0920  aminopeptidase N  43.26 
 
 
863 aa  652    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1033  aminopeptidase N  49.6 
 
 
870 aa  855    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00218696  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19807  predicted protein  49.89 
 
 
869 aa  846    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137348  normal  0.504611 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1015  aminopeptidase N  50 
 
 
897 aa  842    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2439  aminopeptidase N  46.49 
 
 
849 aa  803    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.385207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1919  aminopeptidase N  48.14 
 
 
885 aa  803    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.280956  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0439  aminopeptidase N  44.34 
 
 
875 aa  764    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.956932  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1779  aminopeptidase N  47.06 
 
 
849 aa  811    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0345573 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4053  aminopeptidase N  48.81 
 
 
847 aa  770    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339563  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1451  aminopeptidase N  49.26 
 
 
870 aa  851    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1150  aminopeptidase N  48.68 
 
 
926 aa  822    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22688  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1586  aminopeptidase N  46.18 
 
 
852 aa  751    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109191  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4749  aminopeptidase N  47.69 
 
 
876 aa  820    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0616  aminopeptidase N  45.13 
 
 
883 aa  752    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2759  aminopeptidase N  49.34 
 
 
900 aa  813    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2344  aminopeptidase N  49.26 
 
 
880 aa  846    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2067  aminopeptidase N  59.66 
 
 
880 aa  1068    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>