22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0327 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0327  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.126793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3889  extracellular ligand-binding receptor  34.65 
 
 		 541 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0819  hypothetical protein  58.18 
 
 		 55 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.228351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1257  ABC transporter, periplasmic-substrate binding protein, putative  33.08 
 
 		 541 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2460  cytochrome c  32.81 
 
 		 508 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.360393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1483  cytochrome c family protein, putative  34.21 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1397  cytochrome c family protein, putative  32.64 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3486  cytochrome c, putative  31.54 
 
 		 559 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0158874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2285  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  32.06 
 
 		 559 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2293  hypothetical protein  32.58 
 
 		 526 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2628  cytochrome c, putative  32.28 
 
 		 551 aa  58.9  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2451  cytochrome c  30.77 
 
 		 558 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.131224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1979  cytochrome c, putative  31.54 
 
 		 516 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3792  hypothetical protein  29.55 
 
 		 635 aa  51.6  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4696  hypothetical protein  30.53 
 
 		 541 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.797222  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  28.43 
 
 		 881 aa  45.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  31.07 
 
 		 268 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1065  hypothetical protein  31.87 
 
 		 416 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145619  normal  0.0411422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0648  cytochrome c family protein  30.83 
 
 		 332 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4265  cytochrome c, class I  33 
 
 		 466 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105526  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0973  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.53 
 
 		 304 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0851  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.99 
 
 		 304 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.569662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>