15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2293 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2293  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1063    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4696  hypothetical protein  70.45 
 
 		 541 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.797222  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3792  hypothetical protein  34.13 
 
 		 635 aa  307  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1397  cytochrome c family protein, putative  35.84 
 
 		 567 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1483  cytochrome c family protein, putative  33.27 
 
 		 563 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2285  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  27.59 
 
 		 559 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2451  cytochrome c  28.12 
 
 		 558 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.131224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3486  cytochrome c, putative  27.82 
 
 		 559 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0158874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2460  cytochrome c  26.97 
 
 		 508 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.360393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2628  cytochrome c, putative  36.15 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1979  cytochrome c, putative  28.24 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3889  extracellular ligand-binding receptor  26.06 
 
 		 541 aa  70.5  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1257  ABC transporter, periplasmic-substrate binding protein, putative  23.81 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0327  hypothetical protein  32.58 
 
 		 187 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.126793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1065  hypothetical protein  32.46 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145619  normal  0.0411422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>