15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4696 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2293  hypothetical protein  70.45 
 
 		 526 aa  711    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4696  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1095    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.797222  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3792  hypothetical protein  36.27 
 
 		 635 aa  325  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1483  cytochrome c family protein, putative  33.15 
 
 		 563 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1397  cytochrome c family protein, putative  31.73 
 
 		 567 aa  250  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3889  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1979  cytochrome c, putative  25.32 
 
 		 516 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2628  cytochrome c, putative  34.62 
 
 		 551 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2285  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.81 
 
 		 559 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2451  cytochrome c  27.47 
 
 		 558 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.131224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1257  ABC transporter, periplasmic-substrate binding protein, putative  22.5 
 
 		 541 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3486  cytochrome c, putative  27.73 
 
 		 559 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0158874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145619  normal  0.0411422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2460  cytochrome c  30.98 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.360393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0327  hypothetical protein  30.53 
 
 		 187 aa  50.8  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.126793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>