15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1065 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1065  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  807    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145619  normal  0.0411422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1979  cytochrome c, putative  28.44 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3486  cytochrome c, putative  32.45 
 
 		 559 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0158874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2460  cytochrome c  32.56 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.360393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2285  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  33.75 
 
 		 559 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2451  cytochrome c  32.43 
 
 		 558 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.131224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3792  hypothetical protein  33.52 
 
 		 635 aa  69.7  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3889  extracellular ligand-binding receptor  29.74 
 
 		 541 aa  63.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4696  hypothetical protein  35.09 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.797222  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1257  ABC transporter, periplasmic-substrate binding protein, putative  27.32 
 
 		 541 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2628  cytochrome c, putative  36 
 
 		 551 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2293  hypothetical protein  32.46 
 
 		 526 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1397  cytochrome c family protein, putative  25.44 
 
 		 567 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1483  cytochrome c family protein, putative  25.44 
 
 		 563 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0327  hypothetical protein  31.87 
 
 		 187 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.126793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>