27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1669 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1669  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  720    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.517852  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1238  hypothetical protein  50.15 
 
 
347 aa  343  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196334  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1886  NMD3 family protein  52.32 
 
 
324 aa  340  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0860054  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0828  hypothetical protein  45.48 
 
 
345 aa  332  8e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0924  hypothetical protein  45.06 
 
 
363 aa  322  5e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.642207  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0723  hypothetical protein  31.33 
 
 
351 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000666486  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2215  NMD3 family protein  35.02 
 
 
368 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.208513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0198  hypothetical protein  27.84 
 
 
354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2033  NMD3 family protein  31.94 
 
 
383 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0203  NMD3 family protein  31.2 
 
 
402 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1198  NMD3 family protein  28.53 
 
 
371 aa  143  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303691  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0370  hypothetical protein  25.75 
 
 
353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00583376  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1010  NMD3 family protein  27.98 
 
 
378 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1149  NMD3 family protein  23.46 
 
 
332 aa  103  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1502  hypothetical protein  28.47 
 
 
379 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0329329  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1307  hypothetical protein  24.23 
 
 
362 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343313  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0657  NMD3 family protein  28.46 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.451863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1299  hypothetical protein  28.46 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.390073  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1377  hypothetical protein  27.41 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0192  NMD3 family protein  25.4 
 
 
237 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1840  hypothetical protein  21.77 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0577  hypothetical protein  21.68 
 
 
285 aa  63.2  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0699  NMD3 family protein  22.89 
 
 
289 aa  62.8  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1765  hypothetical protein  22.8 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0454  hypothetical protein  26.6 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1674  hypothetical protein  18.28 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0136926 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0660  hypothetical protein  22.17 
 
 
231 aa  49.7  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000258046  normal  0.0100764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>