27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0660 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0660  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000258046  normal  0.0100764 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0192  NMD3 family protein  45.38 
 
 		 237 aa  228  7e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0454  hypothetical protein  27.19 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0198  hypothetical protein  21.67 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0723  hypothetical protein  23.44 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000666486  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0370  hypothetical protein  22.86 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00583376  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0924  hypothetical protein  25.37 
 
 		 363 aa  62.4  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.642207  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1765  hypothetical protein  24.26 
 
 		 310 aa  62  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1149  NMD3 family protein  28.63 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2215  NMD3 family protein  26.56 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.208513 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1307  hypothetical protein  26.34 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343313  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1502  hypothetical protein  25.25 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0329329  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0577  hypothetical protein  25 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0657  NMD3 family protein  24.77 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.451863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1299  hypothetical protein  24.77 
 
 		 362 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.390073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1377  hypothetical protein  23.98 
 
 		 362 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1840  hypothetical protein  23.93 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2033  NMD3 family protein  28.24 
 
 		 383 aa  52.8  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1238  hypothetical protein  22.98 
 
 		 347 aa  52  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0203  NMD3 family protein  28.57 
 
 		 402 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0699  NMD3 family protein  21.19 
 
 		 289 aa  50.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1669  hypothetical protein  22.17 
 
 		 347 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.517852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15862  predicted protein  22.87 
 
 		 530 aa  48.5  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0977616  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1674  hypothetical protein  22.41 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0136926 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01711  nonsense-mediated mRNA decay protein 3 (AFU_orthologue; AFUA_2G16750)  24.39 
 
 		 511 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.687985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1010  NMD3 family protein  23.48 
 
 		 378 aa  45.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1198  NMD3 family protein  25.88 
 
 		 371 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>