27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1377 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0657  NMD3 family protein  94.2 
 
 		 362 aa  709    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.451863  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1299  hypothetical protein  94.48 
 
 		 362 aa  715    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.390073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1377  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  743    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1307  hypothetical protein  77.56 
 
 		 362 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343313  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1502  hypothetical protein  59.26 
 
 		 379 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0329329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0198  hypothetical protein  32.01 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0370  hypothetical protein  31.82 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00583376  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1238  hypothetical protein  28.49 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0723  hypothetical protein  26.07 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000666486  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1149  NMD3 family protein  24.53 
 
 		 332 aa  93.2  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2215  NMD3 family protein  26.01 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.208513 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1669  hypothetical protein  27.41 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.517852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1886  NMD3 family protein  27.23 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0860054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1010  NMD3 family protein  28.21 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2033  NMD3 family protein  23.25 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0924  hypothetical protein  25.07 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.642207  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1840  hypothetical protein  27 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0203  NMD3 family protein  24.71 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1198  NMD3 family protein  26.88 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0699  NMD3 family protein  29.33 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0828  hypothetical protein  35.48 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0454  hypothetical protein  22.71 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0577  hypothetical protein  23.79 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1765  hypothetical protein  21.07 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0192  NMD3 family protein  24.32 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1674  hypothetical protein  23.6 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0136926 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0660  hypothetical protein  23.98 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000258046  normal  0.0100764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>