26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1886 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1886  NMD3 family protein  100 
 
 		 324 aa  661    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0860054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1669  hypothetical protein  52.32 
 
 		 347 aa  351  8e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.517852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1238  hypothetical protein  48.44 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0828  hypothetical protein  43.3 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0924  hypothetical protein  40.43 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.642207  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0723  hypothetical protein  33.23 
 
 		 351 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000666486  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0198  hypothetical protein  32.03 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2215  NMD3 family protein  31.54 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.208513 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0203  NMD3 family protein  30.77 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2033  NMD3 family protein  34.45 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1198  NMD3 family protein  27.27 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.303691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1010  NMD3 family protein  29.5 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1149  NMD3 family protein  27.97 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0370  hypothetical protein  28.21 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00583376  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1307  hypothetical protein  26.61 
 
 		 362 aa  99  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343313  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0657  NMD3 family protein  25.71 
 
 		 362 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.451863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1502  hypothetical protein  26.74 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0329329  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1299  hypothetical protein  25.55 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.390073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1377  hypothetical protein  27.23 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0699  NMD3 family protein  25.49 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0577  hypothetical protein  26.45 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1674  hypothetical protein  21.76 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0136926 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1840  hypothetical protein  23.72 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.343314 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0192  NMD3 family protein  26.92 
 
 		 237 aa  52.8  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0454  hypothetical protein  22.78 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1765  hypothetical protein  20.14 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>