25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1765 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1765  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0577  hypothetical protein  32.14 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0699  NMD3 family protein  32.45 
 
 
289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1674  hypothetical protein  27.62 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0136926 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1840  hypothetical protein  30.28 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0454  hypothetical protein  27 
 
 
349 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0198  hypothetical protein  27.9 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0723  hypothetical protein  24.14 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000666486  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1149  NMD3 family protein  25 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0192  NMD3 family protein  31.21 
 
 
237 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2215  NMD3 family protein  24.63 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.208513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1238  hypothetical protein  21.01 
 
 
347 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1377  hypothetical protein  21.07 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0660  hypothetical protein  24.26 
 
 
231 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000258046  normal  0.0100764 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1307  hypothetical protein  21.75 
 
 
362 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1669  hypothetical protein  22.8 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.517852  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0370  hypothetical protein  22.37 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00583376  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0657  NMD3 family protein  20.4 
 
 
362 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.451863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1502  hypothetical protein  23.77 
 
 
379 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0329329  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1299  hypothetical protein  20.4 
 
 
362 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.390073  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2033  NMD3 family protein  21.81 
 
 
383 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0924  hypothetical protein  23.46 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.642207  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0203  NMD3 family protein  20.71 
 
 
402 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0828  hypothetical protein  21.34 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1886  NMD3 family protein  20.42 
 
 
324 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0860054  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>