More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0836 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0836  argininosuccinate synthase  100 
 
 
403 aa  830    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2320  argininosuccinate synthase  73.26 
 
 
395 aa  620  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.301901  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0995  argininosuccinate synthase  70.92 
 
 
395 aa  598  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0324417  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1291  argininosuccinate synthase  66.5 
 
 
402 aa  588  1e-167  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.677215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0116  argininosuccinate synthase  69.67 
 
 
395 aa  585  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2373  argininosuccinate synthase  65.22 
 
 
395 aa  551  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.988806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0873  argininosuccinate synthase  65.8 
 
 
394 aa  533  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1445  argininosuccinate synthase  57.91 
 
 
394 aa  488  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0875  argininosuccinate synthase  52.51 
 
 
397 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1072  argininosuccinate synthase  52.51 
 
 
397 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1086  argininosuccinate synthase  52.01 
 
 
397 aa  424  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.287762  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1604  argininosuccinate synthase  52.76 
 
 
397 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2619  argininosuccinate synthase  50.37 
 
 
412 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0622  argininosuccinate synthase  52.3 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1505  argininosuccinate synthase  50.64 
 
 
404 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1764  argininosuccinate synthase  49.23 
 
 
409 aa  395  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0769  argininosuccinate synthase  50.26 
 
 
424 aa  395  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853657  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0331  argininosuccinate synthase  49.22 
 
 
429 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  46.62 
 
 
397 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  45.45 
 
 
413 aa  361  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  45.85 
 
 
409 aa  359  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  46.78 
 
 
420 aa  356  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  47.58 
 
 
400 aa  354  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  47.07 
 
 
400 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  46.56 
 
 
399 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  47.07 
 
 
400 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1286  argininosuccinate synthase  45.2 
 
 
399 aa  351  2e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0228509 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  46.19 
 
 
410 aa  349  5e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000488823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  47.19 
 
 
401 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  45.02 
 
 
406 aa  348  1e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000184052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  47.19 
 
 
408 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  45.02 
 
 
406 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  44.99 
 
 
400 aa  346  4e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  45.76 
 
 
399 aa  344  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  45.99 
 
 
406 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000173868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  45.76 
 
 
400 aa  343  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  46.06 
 
 
401 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  44.44 
 
 
401 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  46.17 
 
 
401 aa  339  7e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  46.06 
 
 
399 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  46.06 
 
 
399 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  44.2 
 
 
401 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  44.73 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  44.2 
 
 
401 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  44.73 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  44.2 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  44.2 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  46.02 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  44.2 
 
 
401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  45.73 
 
 
410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  44.05 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  45.06 
 
 
399 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  43.95 
 
 
401 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000068553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  44.78 
 
 
401 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  43.7 
 
 
401 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000272257  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  44.22 
 
 
402 aa  333  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  45.39 
 
 
406 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  44.55 
 
 
403 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3169  argininosuccinate synthase  43.56 
 
 
400 aa  330  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0199881 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1792  argininosuccinate synthase  44.13 
 
 
399 aa  328  8e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0665468  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  44.81 
 
 
407 aa  328  9e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1459  argininosuccinate synthase  44.61 
 
 
408 aa  328  9e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  43.18 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  43.21 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  43.03 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  44.67 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  44.44 
 
 
401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  45.09 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0674  argininosuccinate synthase  42.78 
 
 
404 aa  326  5e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  45.18 
 
 
403 aa  326  5e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  44.33 
 
 
1496 aa  323  4e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1743  argininosuccinate synthase  42.53 
 
 
400 aa  322  9.000000000000001e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2025  argininosuccinate synthase  42.93 
 
 
399 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.224526 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0125  argininosuccinate synthase  43 
 
 
396 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  44.86 
 
 
405 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18981  argininosuccinate synthase  42.28 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  43.46 
 
 
407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  42.78 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19171  argininosuccinate synthase  43.04 
 
 
404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.320605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  45.22 
 
 
405 aa  319  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1834  argininosuccinate synthase  44.25 
 
 
387 aa  318  1e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.98788  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1317  argininosuccinate synthase  43.15 
 
 
400 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.241417  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1800  argininosuccinate synthase  42.82 
 
 
404 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  42.28 
 
 
407 aa  316  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  42.64 
 
 
402 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1931  argininosuccinate synthase  42.86 
 
 
407 aa  315  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00337254  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26590  argininosuccinate synthase  42.54 
 
 
404 aa  315  7e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  44.58 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21901  argininosuccinate synthase  42.89 
 
 
400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.898377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  43.96 
 
 
403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  44.47 
 
 
411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  45.62 
 
 
399 aa  312  4.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1257  argininosuccinate synthase  43.67 
 
 
401 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0662226 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18441  argininosuccinate synthase  43.3 
 
 
400 aa  312  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.493222 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0980  argininosuccinate synthase  43.95 
 
 
401 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0566774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0961  argininosuccinate synthase  43.95 
 
 
401 aa  312  7.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00623477  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1700  argininosuccinate synthase  45.05 
 
 
406 aa  311  9e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.220206  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0556  argininosuccinate synthase  42.78 
 
 
405 aa  311  9e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0923  argininosuccinate synthase  42.86 
 
 
404 aa  310  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.909799  hitchhiker  0.00000000000000121809 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0939  argininosuccinate synthase  42.82 
 
 
406 aa  311  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0262838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>