More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2373 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2373  argininosuccinate synthase  100 
 
 
395 aa  811    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.988806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0873  argininosuccinate synthase  78.48 
 
 
394 aa  664    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1445  argininosuccinate synthase  67.96 
 
 
394 aa  577  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1291  argininosuccinate synthase  66.41 
 
 
402 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.677215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0995  argininosuccinate synthase  66.24 
 
 
395 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0324417  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0836  argininosuccinate synthase  65.22 
 
 
403 aa  551  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0116  argininosuccinate synthase  64.25 
 
 
395 aa  542  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2320  argininosuccinate synthase  64.49 
 
 
395 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.301901  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1505  argininosuccinate synthase  54.31 
 
 
404 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2619  argininosuccinate synthase  53.85 
 
 
412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1086  argininosuccinate synthase  53.77 
 
 
397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.287762  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0875  argininosuccinate synthase  53.57 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1072  argininosuccinate synthase  53.32 
 
 
397 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0769  argininosuccinate synthase  53.94 
 
 
424 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853657  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1764  argininosuccinate synthase  53.2 
 
 
409 aa  437  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0622  argininosuccinate synthase  53.79 
 
 
401 aa  433  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1604  argininosuccinate synthase  53.77 
 
 
397 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0331  argininosuccinate synthase  51.68 
 
 
429 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
409 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1286  argininosuccinate synthase  48.49 
 
 
399 aa  385  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0228509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  48.09 
 
 
400 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  47.31 
 
 
400 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  49.23 
 
 
399 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  47.59 
 
 
400 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  47.34 
 
 
400 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  46.73 
 
 
413 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  46.8 
 
 
400 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  48 
 
 
408 aa  364  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  48.11 
 
 
410 aa  363  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000488823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  46.43 
 
 
406 aa  360  3e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000184052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  46.68 
 
 
406 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000173868  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  46.43 
 
 
406 aa  360  3e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  45.41 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  45.32 
 
 
400 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  48.14 
 
 
410 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  46.85 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  48.72 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  48.72 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  45.57 
 
 
402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  46.48 
 
 
401 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  49.37 
 
 
1496 aa  357  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  47.58 
 
 
397 aa  356  5e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  47.09 
 
 
401 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  45.2 
 
 
400 aa  355  8.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  45.45 
 
 
399 aa  353  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  46.82 
 
 
401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  46.08 
 
 
401 aa  351  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  47.86 
 
 
401 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1459  argininosuccinate synthase  47.86 
 
 
408 aa  351  1e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  47.33 
 
 
420 aa  349  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  44.95 
 
 
401 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  44.87 
 
 
402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  44.13 
 
 
403 aa  343  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  44.36 
 
 
407 aa  342  9e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  47.59 
 
 
412 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  43.88 
 
 
403 aa  341  2e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  45.59 
 
 
406 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  47.34 
 
 
413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4158  argininosuccinate synthase  46.68 
 
 
405 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0852735  normal  0.163205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  45.23 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000068553  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  47.34 
 
 
413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  43.83 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  47.09 
 
 
413 aa  336  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  44.72 
 
 
401 aa  336  5e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  45.09 
 
 
402 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  46.58 
 
 
413 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0939  argininosuccinate synthase  44.33 
 
 
406 aa  335  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0262838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  44.47 
 
 
401 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  44.47 
 
 
401 aa  333  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  45.59 
 
 
401 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  45.48 
 
 
414 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  46 
 
 
404 aa  333  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  44.47 
 
 
401 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  44.72 
 
 
401 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  44.47 
 
 
401 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  46.84 
 
 
413 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1317  argininosuccinate synthase  44.16 
 
 
400 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.241417  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  46.06 
 
 
402 aa  332  5e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000289862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  46.95 
 
 
404 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0674  argininosuccinate synthase  42.31 
 
 
404 aa  332  8e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  44.22 
 
 
401 aa  332  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  44.22 
 
 
401 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  45.29 
 
 
407 aa  331  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  48.7 
 
 
410 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  44.58 
 
 
407 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  45.32 
 
 
403 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  44.22 
 
 
401 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000272257  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  44.22 
 
 
401 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2025  argininosuccinate synthase  43.62 
 
 
399 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.224526 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  47.12 
 
 
416 aa  330  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1834  argininosuccinate synthase  47.63 
 
 
387 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.98788  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  46.12 
 
 
403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18441  argininosuccinate synthase  42.57 
 
 
400 aa  328  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.493222 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21901  argininosuccinate synthase  43.91 
 
 
400 aa  328  8e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.898377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4140  argininosuccinate synthase  43.88 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  45.78 
 
 
405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  45.57 
 
 
408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  45.57 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  45.43 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  44.64 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>