More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2320 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2320  argininosuccinate synthase  100 
 
 
395 aa  819    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.301901  normal  0.800793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0836  argininosuccinate synthase  73.26 
 
 
403 aa  620  1e-176  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0995  argininosuccinate synthase  71.83 
 
 
395 aa  600  1e-170  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0324417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0116  argininosuccinate synthase  70.3 
 
 
395 aa  589  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1291  argininosuccinate synthase  67.53 
 
 
402 aa  586  1e-166  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.677215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0873  argininosuccinate synthase  66.84 
 
 
394 aa  542  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2373  argininosuccinate synthase  64.49 
 
 
395 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.988806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1445  argininosuccinate synthase  60.26 
 
 
394 aa  508  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2619  argininosuccinate synthase  53.06 
 
 
412 aa  430  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1086  argininosuccinate synthase  52.55 
 
 
397 aa  423  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.287762  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1072  argininosuccinate synthase  51.89 
 
 
397 aa  421  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0875  argininosuccinate synthase  51.13 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1604  argininosuccinate synthase  51.92 
 
 
397 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1505  argininosuccinate synthase  52.69 
 
 
404 aa  409  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1764  argininosuccinate synthase  53.11 
 
 
409 aa  402  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0331  argininosuccinate synthase  52.59 
 
 
429 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0769  argininosuccinate synthase  51.93 
 
 
424 aa  397  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853657  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0622  argininosuccinate synthase  50.39 
 
 
401 aa  394  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  46.31 
 
 
397 aa  352  8e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  47.94 
 
 
406 aa  350  2e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000184052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  48.2 
 
 
406 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000173868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  47.3 
 
 
400 aa  348  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  47.52 
 
 
420 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  47.68 
 
 
406 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  45.5 
 
 
413 aa  347  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  45.52 
 
 
400 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  46.17 
 
 
409 aa  342  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  47.22 
 
 
401 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  46.27 
 
 
400 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1286  argininosuccinate synthase  46.74 
 
 
399 aa  340  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0228509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  44.99 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  45.24 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  47.58 
 
 
406 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  46.11 
 
 
410 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000488823  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  44.73 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  45.36 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  47.47 
 
 
408 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  46.72 
 
 
401 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  45.5 
 
 
402 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  44.11 
 
 
400 aa  335  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1459  argininosuccinate synthase  45.85 
 
 
408 aa  335  1e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  44.19 
 
 
399 aa  333  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  45.27 
 
 
403 aa  332  8e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  45.39 
 
 
401 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  45.3 
 
 
402 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18981  argininosuccinate synthase  43.96 
 
 
404 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  44.78 
 
 
403 aa  329  6e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  44.75 
 
 
401 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  45.9 
 
 
401 aa  328  7e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  46.65 
 
 
407 aa  328  7e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  46.75 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  44.42 
 
 
410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  44.53 
 
 
401 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  44.64 
 
 
401 aa  327  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000068553  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1800  argininosuccinate synthase  43.83 
 
 
404 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  44.42 
 
 
401 aa  325  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19171  argininosuccinate synthase  43.7 
 
 
404 aa  325  9e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.320605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  44.64 
 
 
401 aa  325  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  43.4 
 
 
1496 aa  324  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3169  argininosuccinate synthase  44.07 
 
 
400 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0199881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  43.61 
 
 
399 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  43.61 
 
 
399 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  44.39 
 
 
401 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0731  argininosuccinate synthase  46.53 
 
 
410 aa  323  3e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000184942  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0939  argininosuccinate synthase  43.96 
 
 
406 aa  323  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0262838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  44.14 
 
 
401 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  44.14 
 
 
401 aa  322  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  43.7 
 
 
400 aa  322  6e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0125  argininosuccinate synthase  43.26 
 
 
396 aa  322  7e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1743  argininosuccinate synthase  43.04 
 
 
400 aa  322  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  44.14 
 
 
401 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  43.89 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000272257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  44.95 
 
 
401 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1345  argininosuccinate synthase  44.55 
 
 
404 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000339578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  44.59 
 
 
403 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  45.64 
 
 
403 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1792  argininosuccinate synthase  43.26 
 
 
399 aa  317  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0665468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0179  argininosuccinate synthase  45.5 
 
 
405 aa  317  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0125  argininosuccinate synthase  43 
 
 
397 aa  316  4e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.035307  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1834  argininosuccinate synthase  45.48 
 
 
387 aa  316  5e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.98788  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2025  argininosuccinate synthase  43.56 
 
 
399 aa  315  8e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.224526 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  43.11 
 
 
407 aa  314  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1647  argininosuccinate synthase  43.04 
 
 
412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1249  argininosuccinate synthase  42.82 
 
 
403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000123934  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1503  argininosuccinate synthase  41.75 
 
 
401 aa  312  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  43.56 
 
 
402 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1317  argininosuccinate synthase  42.13 
 
 
400 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.241417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  44.85 
 
 
401 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  47.22 
 
 
399 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1502  argininosuccinate synthase  42.27 
 
 
401 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  44.25 
 
 
413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18441  argininosuccinate synthase  42.89 
 
 
400 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.493222 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0810  argininosuccinate synthase  41.24 
 
 
412 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.179687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3068  argininosuccinate synthase  43.3 
 
 
402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.361572 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21901  argininosuccinate synthase  41.88 
 
 
400 aa  309  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.898377 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14340  argininosuccinate synthase  42.05 
 
 
413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00907828  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2970  argininosuccinate synthase  45.85 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0698642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>