More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1792 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0125  argininosuccinate synthase  87.06 
 
 
396 aa  729    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132712  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1792  argininosuccinate synthase  100 
 
 
399 aa  819    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0665468  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0125  argininosuccinate synthase  72.66 
 
 
397 aa  608  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.035307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  68.1 
 
 
406 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  65.91 
 
 
401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  66.92 
 
 
402 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  65.4 
 
 
401 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  65.4 
 
 
401 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  65.4 
 
 
401 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  65.4 
 
 
401 aa  568  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  65.4 
 
 
401 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  65.4 
 
 
401 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  65.15 
 
 
401 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000068553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  65.4 
 
 
401 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000272257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  65.91 
 
 
401 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  65.4 
 
 
401 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0731  argininosuccinate synthase  65.13 
 
 
410 aa  526  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000184942  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0939  argininosuccinate synthase  61.9 
 
 
406 aa  525  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0262838  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1459  argininosuccinate synthase  64.05 
 
 
408 aa  527  1e-148  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0549  argininosuccinate synthase  60.51 
 
 
401 aa  508  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0961  argininosuccinate synthase  60.31 
 
 
401 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00623477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0980  argininosuccinate synthase  60.31 
 
 
401 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0566774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  62.6 
 
 
420 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  53.44 
 
 
406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000184052  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26590  argininosuccinate synthase  54.73 
 
 
404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  53.69 
 
 
406 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000173868  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  54.2 
 
 
410 aa  444  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000488823  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  53.44 
 
 
406 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2339  argininosuccinate synthase  56.27 
 
 
464 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3169  argininosuccinate synthase  54.48 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0199881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  51.39 
 
 
409 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  54.22 
 
 
400 aa  440  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  52.41 
 
 
413 aa  435  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  52.97 
 
 
397 aa  437  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1335  argininosuccinate synthase  53.79 
 
 
399 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  54.04 
 
 
401 aa  431  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  51.9 
 
 
400 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1743  argininosuccinate synthase  53.21 
 
 
400 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  52.55 
 
 
400 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2025  argininosuccinate synthase  53.21 
 
 
399 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.224526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25570  argininosuccinate synthase  53.16 
 
 
402 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  52.9 
 
 
402 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2157  argininosuccinate synthase  52.44 
 
 
400 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000388575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  52.55 
 
 
401 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  50.25 
 
 
399 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0810  argininosuccinate synthase  51.89 
 
 
412 aa  422  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.179687  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  51.89 
 
 
400 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  52.39 
 
 
400 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  50.63 
 
 
400 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  51.13 
 
 
399 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  51.66 
 
 
401 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21680  argininosuccinate synthase  52.21 
 
 
412 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  51.13 
 
 
400 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0485  argininosuccinate synthase  52.54 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  52.53 
 
 
1496 aa  413  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6071  Argininosuccinate synthase  51.41 
 
 
399 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
403 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1117  argininosuccinate synthase  51.64 
 
 
413 aa  412  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1503  argininosuccinate synthase  52.42 
 
 
401 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310593 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  50.26 
 
 
401 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
399 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  50.77 
 
 
403 aa  408  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
410 aa  411  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0674  argininosuccinate synthase  51.15 
 
 
404 aa  408  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1502  argininosuccinate synthase  52.42 
 
 
401 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1257  argininosuccinate synthase  50.64 
 
 
401 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0662226 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22270  argininosuccinate synthase  51.64 
 
 
414 aa  411  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.833135  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18981  argininosuccinate synthase  49.11 
 
 
404 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  51.02 
 
 
399 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2052  argininosuccinate synthase  51.93 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1647  argininosuccinate synthase  50.88 
 
 
412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3068  argininosuccinate synthase  51.41 
 
 
402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.361572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1894  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
402 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.277901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1887  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
403 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116306  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2367  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
413 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.518406  hitchhiker  0.00688417 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1317  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
400 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.241417  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1659  argininosuccinate synthase  51.69 
 
 
398 aa  404  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.131468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  48.48 
 
 
401 aa  401  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2966  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
400 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19171  argininosuccinate synthase  48.61 
 
 
404 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.320605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3010  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
400 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3308  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 
400 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.250337  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3524  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
400 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663284  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2981  argininosuccinate synthase  49.37 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0553526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2835  argininosuccinate synthase  48.86 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.480011  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21901  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.898377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  50.13 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18441  argininosuccinate synthase  49.75 
 
 
400 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.493222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  46.8 
 
 
407 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1800  argininosuccinate synthase  47.97 
 
 
404 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  49.1 
 
 
408 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14340  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
413 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00907828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11676  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 
398 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.33354e-18  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  47.34 
 
 
404 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  46.55 
 
 
402 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  48.34 
 
 
401 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  49.23 
 
 
401 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1049  argininosuccinate synthase  48.85 
 
 
407 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1086  argininosuccinate synthase  46.43 
 
 
397 aa  380  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.287762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0344  argininosuccinate synthase  49.49 
 
 
399 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>