More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0674 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0674  argininosuccinate synthase  100 
 
 		 404 aa  840    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0810  argininosuccinate synthase  77.42 
 
 		 412 aa  668    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.179687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2367  argininosuccinate synthase  68.66 
 
 		 413 aa  590  1e-167  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.518406  hitchhiker  0.00688417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22270  argininosuccinate synthase  66.67 
 
 		 414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.833135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1647  argininosuccinate synthase  67.76 
 
 		 412 aa  578  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1117  argininosuccinate synthase  67.17 
 
 		 413 aa  580  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1502  argininosuccinate synthase  66.67 
 
 		 401 aa  577  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21680  argininosuccinate synthase  66.75 
 
 		 412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1503  argininosuccinate synthase  66.16 
 
 		 401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2157  argininosuccinate synthase  65.91 
 
 		 400 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000388575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6071  Argininosuccinate synthase  63.8 
 
 		 399 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14340  argininosuccinate synthase  64.99 
 
 		 413 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00907828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2025  argininosuccinate synthase  63.96 
 
 		 399 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.224526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3068  argininosuccinate synthase  62.91 
 
 		 402 aa  548  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.361572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1887  argininosuccinate synthase  62.31 
 
 		 403 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0116306  normal  0.0366285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1894  argininosuccinate synthase  62.56 
 
 		 402 aa  547  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2835  argininosuccinate synthase  63.22 
 
 		 399 aa  544  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.480011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3308  argininosuccinate synthase  62.53 
 
 		 400 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.250337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2052  argininosuccinate synthase  62.22 
 
 		 399 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2981  argininosuccinate synthase  61.21 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0553526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25570  argininosuccinate synthase  64.5 
 
 		 402 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3524  argininosuccinate synthase  61.52 
 
 		 400 aa  535  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.663284  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2966  argininosuccinate synthase  60.96 
 
 		 400 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1257  argininosuccinate synthase  63.2 
 
 		 401 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0662226 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3010  argininosuccinate synthase  60.96 
 
 		 400 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62133  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11676  argininosuccinate synthase  60.61 
 
 		 398 aa  526  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.33354e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3169  argininosuccinate synthase  57.83 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0199881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1743  argininosuccinate synthase  56.31 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26590  argininosuccinate synthase  50.88 
 
 		 404 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2339  argininosuccinate synthase  54.06 
 
 		 464 aa  430  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0760  argininosuccinate synthase  53.55 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2703  argininosuccinate synthase  52.79 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0964869  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0980  argininosuccinate synthase  51.91 
 
 		 401 aa  411  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0566774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4460  argininosuccinate synthase  50 
 
 		 401 aa  411  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000068553  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0961  argininosuccinate synthase  51.91 
 
 		 401 aa  411  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00623477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4765  argininosuccinate synthase  50 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.638804  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4528  argininosuccinate synthase  49.74 
 
 		 401 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4375  argininosuccinate synthase  50 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00862075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3306  argininosuccinate synthase  50.9 
 
 		 401 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000321819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4880  argininosuccinate synthase  49.74 
 
 		 401 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1792  argininosuccinate synthase  51.15 
 
 		 399 aa  408  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0665468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02900  Argininosuccinate synthase  47.72 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0549  argininosuccinate synthase  50.64 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0497  argininosuccinate synthase  50.26 
 
 		 401 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4364  argininosuccinate synthase  49.62 
 
 		 401 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4764  argininosuccinate synthase  49.74 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000272257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4738  argininosuccinate synthase  49.49 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4748  argininosuccinate synthase  49.74 
 
 		 401 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1659  argininosuccinate synthase  51.03 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.131468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1787  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0125  argininosuccinate synthase  50.77 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132712  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0753  argininosuccinate synthase  50.51 
 
 		 410 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000488823  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2882  argininosuccinate synthase  49.23 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1228  argininosuccinate synthase  49.87 
 
 		 420 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.888538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0009  argininosuccinate synthase  47.21 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359968  normal  0.0603517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0882  argininosuccinate synthase  48.22 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887971  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1459  argininosuccinate synthase  51.03 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1260  argininosuccinate synthase  47.96 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000184052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1848  argininosuccinate synthase  47.97 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0939  argininosuccinate synthase  48.72 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0262838  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1071  argininosuccinate synthase  47.96 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000103773  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1043  argininosuccinate synthase  47.96 
 
 		 406 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000173868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0369  argininosuccinate synthase  47.72 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0777  argininosuccinate synthase  48.34 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2068  argininosuccinate synthase  46.62 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.126531  normal  0.0446065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2308  argininosuccinate synthase  48.74 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0125  argininosuccinate synthase  49.13 
 
 		 397 aa  388  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.035307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4888  argininosuccinate synthase  46.72 
 
 		 399 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1250  argininosuccinate synthase  48.21 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30091  argininosuccinate synthase  49.63 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1044  argininosuccinate synthase  46.68 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2679  argininosuccinate synthase  48.51 
 
 		 403 aa  381  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0731  argininosuccinate synthase  50.64 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000184942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1332  argininosuccinate synthase  47.07 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00292839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1325  argininosuccinate synthase  47.83 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18981  argininosuccinate synthase  45.43 
 
 		 404 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218305  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1378  argininosuccinate synthase  47.45 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4448  argininosuccinate synthase  45.98 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.450242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4385  argininosuccinate synthase  45.98 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18981  argininosuccinate synthase  47.86 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1071  argininosuccinate synthase  46.82 
 
 		 401 aa  375  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0663  argininosuccinate synthase  45.75 
 
 		 410 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21901  argininosuccinate synthase  45.82 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.898377 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19171  argininosuccinate synthase  47.12 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.320605  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1317  argininosuccinate synthase  45.32 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.241417  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18441  argininosuccinate synthase  47.98 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.493222 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1800  argininosuccinate synthase  46.35 
 
 		 404 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  46.19 
 
 		 399 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2285  argininosuccinate synthase  43.42 
 
 		 408 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1335  argininosuccinate synthase  45.25 
 
 		 399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  44.2 
 
 		 1496 aa  353  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0622  argininosuccinate synthase  46.29 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0485  argininosuccinate synthase  45.41 
 
 		 402 aa  352  5e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0875  argininosuccinate synthase  43.01 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1086  argininosuccinate synthase  44.56 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.287762  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1072  argininosuccinate synthase  42.75 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4058  argininosuccinate synthase  43.07 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  42.75 
 
 		 403 aa  345  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3356  argininosuccinate synthase  42.32 
 
 		 402 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1286  argininosuccinate synthase  42.82 
 
 		 399 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0228509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>