65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3307 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3307  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  752    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.501382  normal  0.0574639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0688  hypothetical protein  60.83 
 
 
341 aa  421  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000975099  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_2037  predicted protein  42.16 
 
 
347 aa  119  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417362  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49610  predicted protein  40.91 
 
 
576 aa  89.4  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00404596  decreased coverage  0.000402343 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06730  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 
967 aa  87  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85080  predicted protein  31.1 
 
 
682 aa  83.6  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00789  conserved hypothetical protein  33.54 
 
 
484 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.538469 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01876  DUF21 and CBS domain protein (Mam3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04430)  30.73 
 
 
716 aa  79.3  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.645824  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03590  hemolysin, putative  32.73 
 
 
782 aa  75.1  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  30.83 
 
 
468 aa  67.4  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15320  predicted protein  25.63 
 
 
289 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  23.96 
 
 
437 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  29.01 
 
 
431 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  30.66 
 
 
477 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  28.68 
 
 
442 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  30.88 
 
 
426 aa  56.6  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  28.8 
 
 
429 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47599  predicted protein  28.77 
 
 
567 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  29.06 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  28.57 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  27.86 
 
 
467 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  30.53 
 
 
464 aa  53.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  37.23 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  27.16 
 
 
424 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2559  protein of unknown function DUF21  26.67 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.764151  hitchhiker  0.000350536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  28.57 
 
 
464 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  28.48 
 
 
431 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  27.16 
 
 
424 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  29.71 
 
 
442 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  25.83 
 
 
442 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  27.17 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  25.83 
 
 
442 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  27.37 
 
 
428 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  28.57 
 
 
426 aa  50.4  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  30.88 
 
 
470 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  26.12 
 
 
443 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  27.74 
 
 
424 aa  49.7  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  30.92 
 
 
434 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0518  hypothetical protein  26.67 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  28.12 
 
 
456 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  25.6 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2723  protein of unknown function DUF21  23.82 
 
 
438 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1425  protein of unknown function DUF21  29.32 
 
 
171 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.758313  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  25.55 
 
 
427 aa  47.4  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  28.23 
 
 
425 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  29.27 
 
 
439 aa  47  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0451  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
417 aa  47.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.247844 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  27.75 
 
 
418 aa  46.6  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15621  hypothetical protein  27.54 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  22.7 
 
 
428 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0499  hypothetical protein  21.72 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.279814  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  26.4 
 
 
438 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  26.76 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  23.64 
 
 
424 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  27.86 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  27.86 
 
 
464 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0912  hypothetical protein  29.51 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  23.98 
 
 
441 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  30.69 
 
 
421 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  24.7 
 
 
424 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1137  CBS domain-containing protein  25.53 
 
 
431 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  23.08 
 
 
422 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0640  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  26.8 
 
 
423 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0092  hypothetical protein  25.41 
 
 
435 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>