53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0613 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0613  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0645  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  74.29 
 
 		 445 aa  342  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1944  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.25 
 
 		 447 aa  68.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  33.12 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.82 
 
 		 415 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.3 
 
 		 400 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.75 
 
 		 415 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.91 
 
 		 364 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60730  putative outer membrane protein  30.07 
 
 		 463 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1588  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.12 
 
 		 422 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2620  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.07 
 
 		 437 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0208452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1309  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.49 
 
 		 446 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.613202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.27 
 
 		 419 aa  48.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2640  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.49 
 
 		 446 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3487  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.49 
 
 		 446 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02229  hypothetical protein  26.49 
 
 		 448 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2495  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.49 
 
 		 446 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1313  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  26.49 
 
 		 446 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02268  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.49 
 
 		 448 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2634  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.82 
 
 		 437 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0127967  hitchhiker  0.00000000000285546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2580  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.82 
 
 		 435 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00696507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2531  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.82 
 
 		 435 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876174  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2745  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.82 
 
 		 435 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00852795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2724  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.97 
 
 		 446 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  24.58 
 
 		 417 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3381  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.14 
 
 		 440 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3839  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.22 
 
 		 430 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2503  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.49 
 
 		 446 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0289  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.97 
 
 		 401 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.233106 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  30.33 
 
 		 409 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.66 
 
 		 421 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.51 
 
 		 420 aa  45.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.66 
 
 		 421 aa  45.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.66 
 
 		 421 aa  45.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  27.65 
 
 		 424 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1548  outer membrane protein P1  36.47 
 
 		 453 aa  45.1  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000809472  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  24.06 
 
 		 422 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  29.27 
 
 		 432 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  28.44 
 
 		 412 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.43 
 
 		 450 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  27.27 
 
 		 444 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  27.22 
 
 		 464 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000417169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.68 
 
 		 442 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  24.48 
 
 		 427 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  29.91 
 
 		 427 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  27.74 
 
 		 422 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0306  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.82 
 
 		 449 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.92 
 
 		 429 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.87 
 
 		 426 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4491  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.38 
 
 		 441 aa  42.4  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5070  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.39 
 
 		 437 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2250  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.25 
 
 		 407 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.2 
 
 		 423 aa  41.2  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>