23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0645 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0645  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 		 445 aa  907    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0613  hypothetical protein  74.29 
 
 		 210 aa  342  9e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0614  hypothetical protein  75 
 
 		 224 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1944  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.24 
 
 		 447 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.22 
 
 		 364 aa  53.5  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  23.22 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1548  outer membrane protein P1  23.68 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000809472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4491  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.3 
 
 		 441 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1588  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.39 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4378  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.14 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4009  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.14 
 
 		 441 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.78 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.47 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3839  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.85 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.39 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.26 
 
 		 429 aa  46.6  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0053  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.2 
 
 		 471 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  27.27 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  25.81 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  30.43 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  29.75 
 
 		 409 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.91 
 
 		 400 aa  43.5  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.26 
 
 		 423 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>