59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0032 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0032  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase, putative  100 
 
 
334 aa  660    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.49746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0271  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  31.43 
 
 
388 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1384  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.34 
 
 
381 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00167811  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07050  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  23.13 
 
 
379 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4017  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.1 
 
 
382 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4003  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  25.08 
 
 
384 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0223  Mannitol dehydrogenase domain protein  21.55 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4099  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  25.81 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03455  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.51 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03406  hypothetical protein  26.51 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3933  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.51 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3807  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.51 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0112  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  25.51 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4970  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  25.51 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3902  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  27.11 
 
 
382 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.970231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3964  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  27.11 
 
 
382 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.866494  normal  0.811691 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0106  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.51 
 
 
382 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3788  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  24.92 
 
 
387 aa  116  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1251  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  25.95 
 
 
383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0135  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.09 
 
 
387 aa  115  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.947643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4071  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.81 
 
 
382 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.541542  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3886  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.81 
 
 
382 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4009  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.81 
 
 
382 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0073  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  24.42 
 
 
383 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.804562  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4446  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  24.44 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3779  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  24.42 
 
 
387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3409  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.02 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000437999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0027  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  24.42 
 
 
387 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05975  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase (M1PDH)(MPDH)(MPD)(EC 1.1.1.17) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0F5]  25.43 
 
 
386 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.735037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4127  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  24.42 
 
 
387 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4164  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  24.16 
 
 
382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0030  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.18 
 
 
388 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2191  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.74 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2229  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.74 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2814  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  24.85 
 
 
382 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0053  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  24.56 
 
 
383 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0195  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  24.93 
 
 
384 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3835  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.31 
 
 
384 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.361477  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0089  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  25 
 
 
382 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3209  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.63 
 
 
396 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1848  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  26.11 
 
 
376 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001633  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  23.37 
 
 
382 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.917395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2794  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  25.32 
 
 
386 aa  99.4  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00833  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  22.51 
 
 
382 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0056  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  21.65 
 
 
384 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  23.6 
 
 
490 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  28.1 
 
 
707 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  28.1 
 
 
707 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  24.02 
 
 
493 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  23.03 
 
 
493 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  26.12 
 
 
710 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  22.78 
 
 
497 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  26.12 
 
 
714 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  22.35 
 
 
491 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  17.48 
 
 
497 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  22.86 
 
 
484 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3090  Mannitol dehydrogenase domain  20.69 
 
 
506 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221174  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  24.6 
 
 
728 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  21.71 
 
 
506 aa  42.7  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>