272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00833 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001633  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  95.55 
 
 
382 aa  752    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.917395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00833  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  100 
 
 
382 aa  784    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0195  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  80.58 
 
 
384 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2814  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  79.68 
 
 
382 aa  637    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0089  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  66.49 
 
 
382 aa  518  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03455  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  62.53 
 
 
382 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0106  Mannitol dehydrogenase domain protein  62.53 
 
 
382 aa  474  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3933  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  62.53 
 
 
382 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03406  hypothetical protein  62.53 
 
 
382 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4009  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  63.13 
 
 
382 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3902  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  63.13 
 
 
382 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.970231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3964  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  63.13 
 
 
382 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.866494  normal  0.811691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4071  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  63.13 
 
 
382 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.541542  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3807  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  62.27 
 
 
382 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4099  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  62.01 
 
 
382 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0112  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  62.01 
 
 
382 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0073  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.21 
 
 
383 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.804562  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3886  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  62.86 
 
 
382 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4970  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.74 
 
 
382 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4017  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.74 
 
 
382 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4446  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.21 
 
 
382 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0135  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  62.33 
 
 
387 aa  468  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.947643 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3779  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  59.63 
 
 
387 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0027  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  59.63 
 
 
387 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1251  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.26 
 
 
383 aa  462  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4164  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.21 
 
 
382 aa  461  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4127  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  59.63 
 
 
387 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0053  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  58.9 
 
 
383 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1384  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.63 
 
 
381 aa  392  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00167811  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3409  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  47.77 
 
 
381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000437999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2794  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  45.74 
 
 
386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0271  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  39.95 
 
 
388 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3788  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  40.79 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4003  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  41.41 
 
 
384 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0056  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  40.55 
 
 
384 aa  266  5e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0030  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  36.58 
 
 
388 aa  264  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0223  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.44 
 
 
383 aa  260  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2191  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  39.32 
 
 
368 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2229  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  39.32 
 
 
368 aa  253  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07050  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  46.79 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1848  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  38.44 
 
 
376 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05975  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase (M1PDH)(MPDH)(MPD)(EC 1.1.1.17) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0F5]  37.1 
 
 
386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.735037 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3835  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.6 
 
 
384 aa  229  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.361477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3209  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  34.77 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  30.43 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0032  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase, putative  22.51 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.49746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  26.95 
 
 
498 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  29.09 
 
 
423 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  27.74 
 
 
464 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05330  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  30.47 
 
 
548 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  27.37 
 
 
455 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.52 
 
 
497 aa  89.7  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3317  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.96 
 
 
431 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 
493 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  25.68 
 
 
490 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  26.56 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  29.67 
 
 
486 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  29.67 
 
 
486 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.67 
 
 
486 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0601  Mannitol dehydrogenase domain protein  32.41 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  29.67 
 
 
486 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  27.07 
 
 
499 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  29.67 
 
 
486 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  29.67 
 
 
486 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  27.73 
 
 
520 aa  86.3  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  27.93 
 
 
485 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  30.71 
 
 
485 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  26.32 
 
 
497 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  27.45 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  26.88 
 
 
491 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2406  mannitol dehydrogenase domain protein  26.01 
 
 
482 aa  84  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0249546  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  29.27 
 
 
486 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  29.27 
 
 
486 aa  84  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.28 
 
 
490 aa  83.2  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.9 
 
 
490 aa  82.8  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  24.9 
 
 
490 aa  82.8  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  25 
 
 
488 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.52 
 
 
487 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  24.9 
 
 
452 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  27.42 
 
 
484 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  29.88 
 
 
493 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  26.99 
 
 
471 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  25.48 
 
 
491 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  29.23 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.61 
 
 
495 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  25.19 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  26.52 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  26.52 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.75 
 
 
506 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  26.64 
 
 
486 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  26.52 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  26.52 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  26.52 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  26.52 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  26.52 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  26.12 
 
 
486 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.12 
 
 
486 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3970  mannitol dehydrogenase-like  27.3 
 
 
473 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  26.25 
 
 
486 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.35 
 
 
495 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>