285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4164 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_4164  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  100 
 
 
382 aa  782    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0027  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  81.94 
 
 
387 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0053  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  82.98 
 
 
383 aa  642    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3779  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  81.68 
 
 
387 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0073  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  82.46 
 
 
383 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.804562  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4446  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  97.38 
 
 
382 aa  763    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4127  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  82.2 
 
 
387 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03455  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  78.01 
 
 
382 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03406  hypothetical protein  78.01 
 
 
382 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0112  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  77.75 
 
 
382 aa  598  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3933  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  78.01 
 
 
382 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4099  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  77.75 
 
 
382 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3807  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  77.75 
 
 
382 aa  597  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0106  Mannitol dehydrogenase domain protein  77.75 
 
 
382 aa  597  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4017  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  77.49 
 
 
382 aa  597  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4970  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  77.49 
 
 
382 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3886  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.96 
 
 
382 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3902  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.7 
 
 
382 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.970231  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4009  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.7 
 
 
382 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4071  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.7 
 
 
382 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.541542  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3964  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.7 
 
 
382 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.866494  normal  0.811691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0135  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  76.44 
 
 
387 aa  593  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.947643 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0089  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.78 
 
 
382 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0195  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.74 
 
 
384 aa  471  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001633  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.48 
 
 
382 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.917395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00833  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.21 
 
 
382 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2814  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  61.68 
 
 
382 aa  460  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1251  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  56.77 
 
 
383 aa  428  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1384  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.34 
 
 
381 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00167811  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3409  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  47.66 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000437999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2794  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  43.67 
 
 
386 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3788  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  44.72 
 
 
387 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0056  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  43.54 
 
 
384 aa  293  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4003  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  44.89 
 
 
384 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0271  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  37.34 
 
 
388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07050  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  45.11 
 
 
379 aa  263  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0030  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  35.97 
 
 
388 aa  258  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05975  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase (M1PDH)(MPDH)(MPD)(EC 1.1.1.17) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0F5]  39.47 
 
 
386 aa  256  6e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.735037 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0223  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.36 
 
 
383 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1848  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  37.4 
 
 
376 aa  242  7e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3835  Mannitol dehydrogenase domain protein  36.36 
 
 
384 aa  242  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.361477  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2229  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  38.24 
 
 
368 aa  242  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2191  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  38.24 
 
 
368 aa  242  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3209  Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  34.82 
 
 
396 aa  226  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0032  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase, putative  24.16 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.49746  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31040  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  30.54 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  26.13 
 
 
458 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  28.27 
 
 
498 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  28.01 
 
 
499 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3317  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.76 
 
 
431 aa  100  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.2 
 
 
490 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  27.2 
 
 
490 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  27.2 
 
 
452 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  27.01 
 
 
486 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  26.05 
 
 
488 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.46 
 
 
483 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  27.44 
 
 
486 aa  95.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.93 
 
 
486 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.94 
 
 
486 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.57 
 
 
497 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  31.49 
 
 
471 aa  94.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  26.52 
 
 
486 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  26.05 
 
 
488 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  26.56 
 
 
496 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.32 
 
 
493 aa  93.2  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  26.05 
 
 
488 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  28.16 
 
 
520 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  26.94 
 
 
486 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  26.94 
 
 
486 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  29.7 
 
 
493 aa  92.8  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  26.94 
 
 
486 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.64 
 
 
488 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  26.94 
 
 
490 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0601  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.01 
 
 
452 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  26.16 
 
 
486 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.73 
 
 
485 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  25.67 
 
 
488 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.67 
 
 
488 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.67 
 
 
488 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  29.22 
 
 
485 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  27.8 
 
 
488 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  27.8 
 
 
488 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  25.67 
 
 
488 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  27.8 
 
 
488 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  25.67 
 
 
488 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2406  mannitol dehydrogenase domain protein  28.7 
 
 
482 aa  90.1  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0249546  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.18 
 
 
505 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.57 
 
 
486 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  27.8 
 
 
488 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  26.5 
 
 
485 aa  90.1  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  27.8 
 
 
488 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  27.7 
 
 
459 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  29.18 
 
 
464 aa  89.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  26.82 
 
 
488 aa  89.4  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  27.05 
 
 
497 aa  89.4  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  25.87 
 
 
493 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.51 
 
 
495 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  26.3 
 
 
484 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  26.67 
 
 
485 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  27.01 
 
 
451 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>