More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01416 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01416  transposase  100 
 
 
525 aa  1089    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.853931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00362  transposase  98.1 
 
 
525 aa  1069    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01283  transposase  99.66 
 
 
415 aa  610  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000122879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0281  transposase IS66  46.91 
 
 
531 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0273  transposase IS66  46.91 
 
 
531 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3984  transposase IS66  53.79 
 
 
311 aa  306  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.637718  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  31.27 
 
 
545 aa  206  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  31.27 
 
 
545 aa  206  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  31.27 
 
 
545 aa  206  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  31.27 
 
 
545 aa  206  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  30.69 
 
 
545 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  30.5 
 
 
545 aa  204  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3978  transposase IS66  52.17 
 
 
219 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227501  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3678  transposase IS66  29.35 
 
 
515 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  30.82 
 
 
529 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  28.86 
 
 
504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  28.86 
 
 
504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  31.16 
 
 
537 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  28.86 
 
 
504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  29.15 
 
 
540 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  29.15 
 
 
540 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  29.15 
 
 
540 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  28.1 
 
 
545 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  28.1 
 
 
545 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  28.1 
 
 
545 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  29.23 
 
 
510 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  31.75 
 
 
520 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  31.75 
 
 
520 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  29.42 
 
 
517 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  27.26 
 
 
545 aa  177  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  29.92 
 
 
523 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  30.12 
 
 
523 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  29.92 
 
 
523 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  29.92 
 
 
523 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  29.92 
 
 
523 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  29.92 
 
 
523 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  30 
 
 
694 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  31.09 
 
 
520 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  29.84 
 
 
511 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  29.84 
 
 
511 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  29.84 
 
 
511 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  29.72 
 
 
523 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  29.55 
 
 
511 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  29.55 
 
 
511 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  28.69 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  30.1 
 
 
505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  28.69 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  28.69 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  28.69 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  30.1 
 
 
505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  29.34 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  28.69 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  30.1 
 
 
505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  27.85 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  28.69 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  29.14 
 
 
511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  28.73 
 
 
506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  31.25 
 
 
507 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  31.25 
 
 
507 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4449  transposase IS66  28.83 
 
 
528 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.543683  normal  0.0438734 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3926  transposase IS66  27.33 
 
 
514 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3964  transposase IS66  27.33 
 
 
514 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3331  transposase IS66  27.33 
 
 
514 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  28.74 
 
 
524 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  28.74 
 
 
524 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  30.2 
 
 
530 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0068  transposase IS66  27.94 
 
 
542 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  28.94 
 
 
511 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0026  transposase IS66  27.7 
 
 
487 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2538  transposase IS66  27.7 
 
 
487 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  30 
 
 
530 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  29.18 
 
 
532 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0638  transposase IS66  29.86 
 
 
514 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0665  transposase IS66  30.39 
 
 
491 aa  170  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  32.35 
 
 
508 aa  170  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3593  transposase IS66  31.48 
 
 
404 aa  170  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.324594  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  29.22 
 
 
524 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  27.46 
 
 
511 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  31.15 
 
 
512 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0610  transposase IS66  29.48 
 
 
514 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  169  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  169  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  30.95 
 
 
512 aa  169  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>