More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3978 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_3978  transposase IS66  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227501  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01283  transposase  52.94 
 
 
415 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000122879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01416  transposase  52.17 
 
 
525 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.853931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00362  transposase  52.17 
 
 
525 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0281  transposase IS66  45.6 
 
 
531 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0273  transposase IS66  45.6 
 
 
531 aa  157  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0575  hypothetical protein  77.36 
 
 
64 aa  92  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  28.21 
 
 
540 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  28.21 
 
 
540 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  28.21 
 
 
540 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5514  transposase IS66  27.59 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  27.59 
 
 
524 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1222  transposase IS66  27.59 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6097  transposase IS66  27.59 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  30.81 
 
 
510 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  30.81 
 
 
510 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  30.81 
 
 
510 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  30.81 
 
 
510 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  30.73 
 
 
529 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  31.36 
 
 
537 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  27.59 
 
 
524 aa  65.9  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  27.59 
 
 
524 aa  65.9  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  33.63 
 
 
511 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  33.63 
 
 
511 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  27.59 
 
 
524 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  30.05 
 
 
517 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  33.63 
 
 
511 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3964  ISPpu14, transposase Orf3  33.63 
 
 
511 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0893475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  33.63 
 
 
511 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  33.63 
 
 
511 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59580  putative transposase  33.63 
 
 
511 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000128729  hitchhiker  1.83127e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0037  transposase IS66  33.63 
 
 
511 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.321823 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0515  transposase IS66  26.57 
 
 
511 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  27.32 
 
 
509 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2669  transposase IS66  27.32 
 
 
509 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870521  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2975  transposase IS66  27.32 
 
 
509 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3322  transposase IS66  27.32 
 
 
509 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0833  transposase IS66  27.32 
 
 
509 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  27.32 
 
 
509 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5173  transposase IS66  32.74 
 
 
511 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2281  transposase  27.39 
 
 
527 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1437  transposase IS66  26.98 
 
 
464 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  27.36 
 
 
517 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  24.12 
 
 
533 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4905  transposase IS66  28.02 
 
 
551 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2203  transposase  29.52 
 
 
530 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2211  transposase  29.52 
 
 
530 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  28.06 
 
 
366 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4978  IS66 family insertion sequence transposase protein  27.78 
 
 
549 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432093  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  27.27 
 
 
503 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  30.99 
 
 
341 aa  59.3  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0711  transposase IS66  27.6 
 
 
545 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  30.3 
 
 
506 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2707  transposase IS66  27.75 
 
 
529 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0584857  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2627  transposase IS66  27.75 
 
 
529 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2970  transposase IS66  27.75 
 
 
529 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0501517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  30.3 
 
 
506 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0278  transposase IS66  32.17 
 
 
508 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  30.3 
 
 
506 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1170  transposase IS66  33.94 
 
 
507 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.438673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3059  transposase IS66  33.94 
 
 
507 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4788  transposase IS66  31.53 
 
 
545 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2728  transposase IS66  31.53 
 
 
545 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0274249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0898  transposase IS66  31.53 
 
 
545 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.888311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1836  transposase IS66  27.75 
 
 
529 aa  58.9  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000394472  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  26.53 
 
 
523 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5078  transposase IS66  33.64 
 
 
279 aa  58.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>