More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01283 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01283  transposase  100 
 
 		 415 aa  863    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000122879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01416  transposase  99.66 
 
 		 525 aa  610  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.853931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00362  transposase  98.64 
 
 		 525 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0281  transposase IS66  45.71 
 
 		 531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0273  transposase IS66  45.71 
 
 		 531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3978  transposase IS66  52.94 
 
 		 219 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227501  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0219  hypothetical protein  51.75 
 
 		 119 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07000  hypothetical protein  43.48 
 
 		 117 aa  103  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000960  hypothetical protein  42.61 
 
 		 117 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000106853  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3669  hypothetical protein  43.56 
 
 		 126 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.515559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  27.87 
 
 		 540 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  27.87 
 
 		 540 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  27.87 
 
 		 540 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1437  transposase IS66  26.8 
 
 		 464 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3984  transposase IS66  58.82 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.637718  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  27.76 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2898  hypothetical protein  38.83 
 
 		 119 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000626898  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6939  transposase IS66  28.28 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  28.76 
 
 		 520 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  28.76 
 
 		 520 aa  83.2  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  28.67 
 
 		 537 aa  83.2  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  26.71 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  26.71 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1481  hypothetical protein  41.23 
 
 		 142 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0384358  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  26.71 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  26.71 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  26.9 
 
 		 524 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  27.51 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  26.04 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  26.04 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  26.04 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  26.06 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  26.74 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  26.74 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  27.59 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0515  transposase IS66  26.91 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.016162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  27.97 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  27.24 
 
 		 524 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  27.24 
 
 		 524 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  26.43 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4443  ISPpu14, transposase Orf3  28.01 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.801949  hitchhiker  0.0000589528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5396  ISPpu14, transposase Orf3  28.01 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118381  hitchhiker  0.00957485 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4021  transposase IS66  25.43 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1998  hypothetical protein  43.75 
 
 		 145 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000213063  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3501  ISPpu14, transposase Orf3  28.01 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3981  ISPpu14, transposase Orf3  28.01 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0385183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4439  ISPpu14, transposase Orf3  28.01 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414491  hitchhiker  0.0000684735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  25.43 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00555  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  77.4  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0572  transposase IS66  25.54 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0648577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2455  transposase IS66  25.54 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2916  transposase IS66  25.54 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  26.15 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  26.15 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  26.15 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  26.27 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  28.62 
 
 		 523 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5535  transposase IS66  25.85 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1222  transposase IS66  29.29 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0906  IS66 family element, transposase  26.38 
 
 		 530 aa  75.5  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2201  hypothetical protein  44.32 
 
 		 152 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4623  IS66 family element, transposase  26.38 
 
 		 530 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1847  IS66 family element, transposase  26.38 
 
 		 530 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2143  IS66 family element, transposase  26.38 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0847  IS66 family element, transposase  26.38 
 
 		 530 aa  75.5  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3899  IS66 family element, transposase  26.38 
 
 		 530 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2961  IS66 family element, transposase  26.38 
 
 		 530 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.834706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>