More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0422 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0422  alanine racemase  100 
 
 		 373 aa  764    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  37.95 
 
 		 375 aa  223  4e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1941  alanine racemase  34.97 
 
 		 370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0017462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  36.6 
 
 		 384 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  36 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  35.85 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  36.66 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  35.85 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  35.85 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  35.85 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  35.85 
 
 		 389 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  35.85 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  35.85 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  35.85 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  35.85 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  35.85 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  33.88 
 
 		 373 aa  205  8e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  32.88 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  34.96 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  34.22 
 
 		 366 aa  193  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0162  alanine racemase  30.65 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  33.24 
 
 		 367 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  31.71 
 
 		 391 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  33.7 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1641  alanine racemase  32.09 
 
 		 386 aa  183  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  32.07 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  34.94 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  29.87 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  31 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  30.71 
 
 		 373 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  32.02 
 
 		 390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  29.03 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  29.03 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  28.27 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  30.98 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  31.59 
 
 		 373 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  29.41 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  32.15 
 
 		 371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  29.68 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  29.68 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  29.41 
 
 		 391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  31.23 
 
 		 386 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  32.35 
 
 		 406 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  30.68 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  29.14 
 
 		 391 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  31.27 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  31.75 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  28.88 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  31.75 
 
 		 403 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  30.55 
 
 		 441 aa  159  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  31.5 
 
 		 421 aa  158  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  29.3 
 
 		 403 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  30.42 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  28.34 
 
 		 391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  32.07 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  29.7 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  30.79 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  28.95 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  30.97 
 
 		 408 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  29.38 
 
 		 851 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  28.88 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  29.62 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  29.62 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  30.86 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  31.97 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  27.59 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  28.49 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  27.75 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  28.96 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  28.93 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  28.76 
 
 		 398 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  30.13 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  30.39 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  28.72 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  32.37 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  26.75 
 
 		 399 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  26.75 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  26.48 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  29.61 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  30.71 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  28.91 
 
 		 395 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  30.97 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1934  alanine racemase  31.28 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138349  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  29.01 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  31.37 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  28.89 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  28.61 
 
 		 395 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  30.46 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  28.91 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  29.3 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  30.36 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  27.13 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  28.23 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  30.73 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  30.33 
 
 		 417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  31.25 
 
 		 378 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  29.25 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  30.06 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  30.06 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  30 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>