More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1641 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1641  alanine racemase  100 
 
 
386 aa  797    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  40.36 
 
 
389 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  39.9 
 
 
389 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  39.64 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  39.64 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  39.64 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  39.64 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  39.64 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  39.39 
 
 
389 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  39.13 
 
 
389 aa  242  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  39.39 
 
 
389 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  38.28 
 
 
366 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  38.46 
 
 
389 aa  239  8e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  38.42 
 
 
375 aa  238  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  38.22 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  36.6 
 
 
387 aa  232  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0910  alanine racemase  35.28 
 
 
367 aa  229  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0868736  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1812  alanine racemase  35.83 
 
 
373 aa  229  6e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000273885  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1941  alanine racemase  35.64 
 
 
370 aa  225  9e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0017462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  36.73 
 
 
384 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0267  alanine racemase  33.16 
 
 
376 aa  209  7e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.227408  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  34.05 
 
 
382 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  34.05 
 
 
382 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  34.55 
 
 
373 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  33.77 
 
 
373 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  34.75 
 
 
390 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0162  alanine racemase  33.07 
 
 
371 aa  191  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  34.38 
 
 
382 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  32.81 
 
 
373 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  31.54 
 
 
380 aa  189  8e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  33.25 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  33.77 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0422  alanine racemase  32.09 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  32.21 
 
 
391 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  32.21 
 
 
391 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  33.42 
 
 
373 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  30.89 
 
 
391 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  31.77 
 
 
391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  32.29 
 
 
391 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  32.03 
 
 
391 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  33.24 
 
 
365 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  32.03 
 
 
391 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  33.08 
 
 
388 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  32.03 
 
 
391 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  32.73 
 
 
392 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  33.42 
 
 
386 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  33.69 
 
 
386 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  34.56 
 
 
380 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  31.77 
 
 
391 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  32.71 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  31.48 
 
 
369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  33.33 
 
 
391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  32.81 
 
 
851 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  31.82 
 
 
364 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  31.95 
 
 
398 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  31.59 
 
 
441 aa  169  9e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  31.95 
 
 
370 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  30.08 
 
 
379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  32.04 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  31.88 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  31.66 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  30.69 
 
 
373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  31.79 
 
 
390 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  30.53 
 
 
390 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  32.01 
 
 
380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  31.22 
 
 
389 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  30.99 
 
 
408 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  30.89 
 
 
382 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  30.77 
 
 
369 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  29.9 
 
 
411 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  31.23 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  30.59 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  31.76 
 
 
397 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  31.25 
 
 
380 aa  152  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  32.87 
 
 
364 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  30.81 
 
 
384 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  30.65 
 
 
421 aa  150  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  30.08 
 
 
377 aa  149  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  30.31 
 
 
379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  32.35 
 
 
811 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  29.97 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  28.79 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  29.95 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  29.95 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  32.87 
 
 
358 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  28.27 
 
 
379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  31.11 
 
 
379 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  31.9 
 
 
376 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  30.85 
 
 
379 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  31.55 
 
 
358 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  31.55 
 
 
358 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  29.26 
 
 
390 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  29.84 
 
 
433 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  31.55 
 
 
358 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  30.97 
 
 
403 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  31.55 
 
 
358 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  31.09 
 
 
403 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1359  alanine racemase  29.1 
 
 
356 aa  142  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  27.73 
 
 
395 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  31.19 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>