More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11080 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11080  amino acid carrier protein  100 
 
 		 498 aa  995    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0903733  normal  0.126289 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21700  amino acid carrier protein  47.18 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2797  amino acid carrier protein  45.7 
 
 		 543 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.566332  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24790  amino acid carrier protein  41.87 
 
 		 502 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.558216  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5513  amino acid carrier protein  46.28 
 
 		 488 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0538617  normal  0.636918 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4424  amino acid carrier protein  44.98 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107897  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  40.21 
 
 		 481 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  40.62 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  40.59 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  40.55 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  40.62 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3671  amino acid carrier protein  43.11 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  40.82 
 
 		 479 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  40.79 
 
 		 479 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  39.46 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  40.41 
 
 		 479 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5205  sodium/alanine symporter family protein  40.21 
 
 		 480 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  40 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  41.1 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19510  amino acid carrier protein  44.65 
 
 		 480 aa  363  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3216  amino acid carrier protein  41.9 
 
 		 458 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  41.1 
 
 		 466 aa  360  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  39.42 
 
 		 477 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  39.42 
 
 		 477 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  39.21 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  38.8 
 
 		 476 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  39.21 
 
 		 476 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  39.21 
 
 		 476 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  39 
 
 		 476 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  38.8 
 
 		 476 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  39 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  39 
 
 		 476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0927  amino acid carrier protein  39.37 
 
 		 485 aa  351  1e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5195  sodium/alanine symporter family protein  39 
 
 		 477 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00448633  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  40.09 
 
 		 470 aa  348  9e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0053  sodium/alanine symporter family protein  38.59 
 
 		 477 aa  346  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00081371  hitchhiker  0.000000000284075 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  39 
 
 		 477 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4874  amino acid carrier protein  39 
 
 		 477 aa  345  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4777  sodium/alanine symporter family protein  38.8 
 
 		 477 aa  343  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0502755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  38.8 
 
 		 477 aa  342  7e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4758  sodium/alanine symporter family protein  38.8 
 
 		 477 aa  342  7e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.336206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5158  sodium/alanine symporter family protein  38.59 
 
 		 477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.16405e-32 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26340  amino acid carrier protein  41.98 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.159841 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  36.65 
 
 		 478 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1445  amino acid carrier protein  39.7 
 
 		 486 aa  329  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000977985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1418  amino acid carrier protein  39.7 
 
 		 486 aa  329  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000791908  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1075  amino acid carrier protein  39.43 
 
 		 504 aa  324  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0124447  hitchhiker  0.00000000000234517 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  39.22 
 
 		 494 aa  317  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1200  amino acid carrier protein  41.36 
 
 		 484 aa  317  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.294812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4714  amino acid carrier protein  41.1 
 
 		 484 aa  317  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  39.44 
 
 		 480 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  39.43 
 
 		 477 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0099  amino acid carrier protein  36.82 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00900834  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  39.65 
 
 		 477 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1077  amino acid carrier protein  40.81 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.282227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  39.74 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  37.17 
 
 		 479 aa  306  5.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3502  Sodium/alanine symporter  36.69 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  38.17 
 
 		 498 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  39.47 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  39.69 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3172  sodium/alanine symporter family protein  35.21 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0512593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1187  amino acid carrier protein  38.44 
 
 		 483 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3046  amino acid carrier protein  39.95 
 
 		 488 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00153895  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  38.08 
 
 		 497 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4664  sodium/alanine symporter family protein  37.42 
 
 		 487 aa  299  8e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.36209e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3165  sodium/alanine symporter family protein  35.92 
 
 		 474 aa  299  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2908  amino acid carrier protein (sodium/alanine symporter)  35.92 
 
 		 474 aa  299  9e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.975197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2858  sodium/alanine symporter family protein  35.21 
 
 		 474 aa  299  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.430762  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  39.52 
 
 		 502 aa  299  9e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3144  sodium/alanine symporter family protein  35.1 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2096  sodium/alanine symporter family protein  35.1 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0706  sodium/alanine symporter family protein  37.01 
 
 		 486 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0334  amino acid carrier protein  36.09 
 
 		 504 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2590  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  36.55 
 
 		 496 aa  296  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0549  sodium/alanine symporter family protein  36.81 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0549  sodium/alanine symporter family protein  36.81 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1431  amino acid carrier protein  35.23 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1496  amino acid carrier protein  35.23 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  37.95 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1842  amino acid carrier protein  35.43 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2836  sodium/alanine symporter family protein  35.27 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000278121 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2633  amino acid carrier protein  36.13 
 
 		 496 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2555  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  36.21 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1231  amino acid carrier protein  36.93 
 
 		 489 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3198  amino acid carrier protein  38.33 
 
 		 483 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0767  sodium/proton-dependent alanine carrier protein  36.61 
 
 		 487 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0325  amino acid carrier protein  35.9 
 
 		 504 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3063  sodium:alanine symporter family protein  35.1 
 
 		 495 aa  293  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2703  amino acid carrier protein  37.64 
 
 		 497 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0404  amino acid carrier protein  37.64 
 
 		 497 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.697686  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1484  amino acid carrier protein  35.32 
 
 		 494 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0673  sodium/alanine symporter family protein  36 
 
 		 487 aa  293  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  36.67 
 
 		 489 aa  293  5e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0605  sodium/alanine symporter family protein  36.61 
 
 		 486 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0638  sodium/alanine symporter family protein  36.61 
 
 		 486 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10930  amino acid carrier protein  40.35 
 
 		 490 aa  292  8e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1092  amino acid carrier protein  37.61 
 
 		 492 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000531923  normal  0.0424482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0096  Sodium/alanine symporter  37.92 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0539  amino acid carrier protein  35.74 
 
 		 486 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0377619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>