14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0324 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0324  RNA-binding protein AU-1  100 
 
 		 463 aa  910    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0315  RNA-binding protein AU-1  58.41 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1408  protein of unknown function DUF402  50.73 
 
 		 494 aa  433  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305223  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0040  protein of unknown function DUF402  51.42 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  0.0289003 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3272  protein of unknown function DUF402  51.69 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1382  hypothetical protein  27.11 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2067  protein of unknown function DUF402  25.38 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0345  hypothetical protein  33.49 
 
 		 319 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0561  hypothetical protein  27.02 
 
 		 491 aa  90.5  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0052  hypothetical protein  26.93 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2040  hypothetical protein  27.69 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00130094 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0970  hypothetical protein  34.2 
 
 		 447 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.524201  normal  0.0268833 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1080  hypothetical protein  34.03 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.108156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2386  hypothetical protein  28.91 
 
 		 188 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125037  hitchhiker  0.00068546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>