13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0561 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0561  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  980    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1408  protein of unknown function DUF402  27.25 
 
 
494 aa  106  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305223  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0052  hypothetical protein  28.08 
 
 
448 aa  102  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1382  hypothetical protein  27.29 
 
 
471 aa  100  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0324  RNA-binding protein AU-1  27.02 
 
 
463 aa  90.5  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0315  RNA-binding protein AU-1  27.33 
 
 
462 aa  87.4  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0970  hypothetical protein  27.89 
 
 
447 aa  87  7e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.524201  normal  0.0268833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3272  protein of unknown function DUF402  25.96 
 
 
478 aa  86.7  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2067  protein of unknown function DUF402  25 
 
 
424 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2040  hypothetical protein  28.76 
 
 
448 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00130094 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1080  hypothetical protein  27.13 
 
 
444 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.108156 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0040  protein of unknown function DUF402  29.09 
 
 
485 aa  56.6  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  0.0289003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0345  hypothetical protein  30.34 
 
 
319 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.195758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>