13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0315 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0315  RNA-binding protein AU-1  100 
 
 		 462 aa  908    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0324  RNA-binding protein AU-1  58.41 
 
 		 463 aa  487  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623805  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0040  protein of unknown function DUF402  53.67 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  0.0289003 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3272  protein of unknown function DUF402  54.51 
 
 		 478 aa  445  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1408  protein of unknown function DUF402  52.28 
 
 		 494 aa  442  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305223  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1382  hypothetical protein  27.08 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0345  hypothetical protein  34.1 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2067  protein of unknown function DUF402  24 
 
 		 424 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0052  hypothetical protein  27.39 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0561  hypothetical protein  27.33 
 
 		 491 aa  87.4  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0970  hypothetical protein  29.12 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.524201  normal  0.0268833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2040  hypothetical protein  28.76 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00130094 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1080  hypothetical protein  28.19 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.108156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>