13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0345 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0345  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0324  RNA-binding protein AU-1  33.49 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623805  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0040  protein of unknown function DUF402  32.86 
 
 		 485 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  0.0289003 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0315  RNA-binding protein AU-1  34.1 
 
 		 462 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3272  protein of unknown function DUF402  32.11 
 
 		 478 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1408  protein of unknown function DUF402  31.05 
 
 		 494 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305223  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1382  hypothetical protein  29.61 
 
 		 471 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2067  protein of unknown function DUF402  30.66 
 
 		 424 aa  86.7  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2040  hypothetical protein  31.35 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00130094 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0970  hypothetical protein  32.43 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.524201  normal  0.0268833 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1080  hypothetical protein  35.29 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.108156 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0052  hypothetical protein  30.27 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0561  hypothetical protein  30.34 
 
 		 491 aa  52.8  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>