13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1382 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1382  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  951    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0052  hypothetical protein  34.32 
 
 
448 aa  197  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2040  hypothetical protein  33.33 
 
 
448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00130094 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0970  hypothetical protein  32.79 
 
 
447 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.524201  normal  0.0268833 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1080  hypothetical protein  30.04 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.108156 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2067  protein of unknown function DUF402  30.75 
 
 
424 aa  143  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0324  RNA-binding protein AU-1  27.11 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623805  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1408  protein of unknown function DUF402  25.91 
 
 
494 aa  124  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305223  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0040  protein of unknown function DUF402  25.77 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  0.0289003 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3272  protein of unknown function DUF402  26.59 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0315  RNA-binding protein AU-1  27.08 
 
 
462 aa  117  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0561  hypothetical protein  27.29 
 
 
491 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0345  hypothetical protein  29.61 
 
 
319 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.195758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>