13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2040 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2040  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  875    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00130094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0052  hypothetical protein  60.8 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1080  hypothetical protein  64.16 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.108156 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0970  hypothetical protein  62.58 
 
 		 447 aa  533  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.524201  normal  0.0268833 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 471 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2067  protein of unknown function DUF402  27.66 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0561  hypothetical protein  28.76 
 
 		 491 aa  83.2  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0324  RNA-binding protein AU-1  27.69 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0315  RNA-binding protein AU-1  28.76 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1408  protein of unknown function DUF402  26.78 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0345  hypothetical protein  31.35 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.195758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3272  protein of unknown function DUF402  30.35 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0040  protein of unknown function DUF402  40.91 
 
 		 485 aa  53.9  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  0.0289003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>