17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1408 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1408  protein of unknown function DUF402  100 
 
 
494 aa  978    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305223  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3272  protein of unknown function DUF402  74.64 
 
 
478 aa  681    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0315  RNA-binding protein AU-1  52.28 
 
 
462 aa  442  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0324  RNA-binding protein AU-1  50.73 
 
 
463 aa  433  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623805  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0040  protein of unknown function DUF402  48.8 
 
 
485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.708501  normal  0.0289003 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1382  hypothetical protein  25.91 
 
 
471 aa  124  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2067  protein of unknown function DUF402  25.92 
 
 
424 aa  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0561  hypothetical protein  27.25 
 
 
491 aa  106  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0345  hypothetical protein  31.05 
 
 
319 aa  97.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.195758  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0052  hypothetical protein  26.8 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0970  hypothetical protein  27.51 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.524201  normal  0.0268833 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1080  hypothetical protein  27.67 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.108156 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2040  hypothetical protein  26.78 
 
 
448 aa  77  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00130094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2964  hypothetical protein  29.03 
 
 
169 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1154  hypothetical protein  30.69 
 
 
172 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.226103  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0005  hypothetical protein  26.13 
 
 
181 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2746  hypothetical protein  32.97 
 
 
156 aa  43.5  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00198972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>