34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1840 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1840  Ribosomal protein S4E, central domain protein  100 
 
 		 265 aa  528  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2304  30S ribosomal protein S4e  75.6 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2437  30S ribosomal protein S4e  65.23 
 
 		 240 aa  324  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2230  Ribosomal protein S4E, central domain protein  64 
 
 		 233 aa  315  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0222  Ribosomal protein S4E, central domain protein  63.24 
 
 		 235 aa  306  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2241  30S ribosomal protein S4e  35.8 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000731595  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0454  30S ribosomal protein S4e  32.92 
 
 		 241 aa  155  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0061334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0013  30S ribosomal protein S4e  36.33 
 
 		 236 aa  152  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000026774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0098  30S ribosomal protein S4e  35.8 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00334877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0544  30S ribosomal protein S4e  32.4 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211539  normal  0.284523 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0167  30S ribosomal protein S4e  35.32 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000856142  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0656  30S ribosomal protein S4e  35.32 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0055669  decreased coverage  0.0000746935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1509  Ribosomal protein S4E, central domain protein  33.33 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.86693e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1262  30S ribosomal protein S4e  34.92 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00343319  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0243  30S ribosomal protein S4e  33.89 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0576  30S ribosomal protein S4e  32.42 
 
 		 242 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.255322  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0722  30S ribosomal protein S4e  32.66 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0126662  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0093  30S ribosomal protein S4e  31.87 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.507041 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1716  30S ribosomal protein S4e  30.83 
 
 		 233 aa  125  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.028053  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1832  30S ribosomal protein S4e  29.63 
 
 		 237 aa  118  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0560  30S ribosomal protein S4e  31.67 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00212032 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0103  30S ribosomal protein S4e  29.27 
 
 		 241 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000259785  unclonable  0.000000558992 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1396  30S ribosomal protein S4e  31.2 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1550  30S ribosomal protein S4e  27.8 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.199736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1747  30S ribosomal protein S4e  29.63 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.015598 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1730  30S ribosomal protein S4e  31.16 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.84836  decreased coverage  0.000360603 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1766  Ribosomal protein S4E, central domain protein  26.92 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17324  predicted protein  29.22 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18526  Ribosomal protein S4, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  28.25 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163807  normal  0.488363 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0798  30S ribosomal protein S4e  26.42 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79556  predicted protein  27.83 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.116079 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34143  ribosomal protein S4  27.83 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04794  40S ribosomal protein S4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06840)  24.49 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06200  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>