34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2437 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2437  30S ribosomal protein S4e  100 
 
 		 240 aa  479  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2230  Ribosomal protein S4E, central domain protein  75.86 
 
 		 233 aa  364  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0222  Ribosomal protein S4E, central domain protein  72.34 
 
 		 235 aa  347  9e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2304  30S ribosomal protein S4e  69.23 
 
 		 286 aa  328  7e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1840  Ribosomal protein S4E, central domain protein  65.23 
 
 		 265 aa  323  2e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2241  30S ribosomal protein S4e  37.99 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000731595  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0454  30S ribosomal protein S4e  37.55 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0061334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0098  30S ribosomal protein S4e  38.84 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00334877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0544  30S ribosomal protein S4e  36.24 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211539  normal  0.284523 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0013  30S ribosomal protein S4e  38.16 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000026774  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0576  30S ribosomal protein S4e  38.1 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.255322  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1509  Ribosomal protein S4E, central domain protein  35.11 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.86693e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0722  30S ribosomal protein S4e  32.62 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0126662  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0167  30S ribosomal protein S4e  32.19 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000856142  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0656  30S ribosomal protein S4e  32.19 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0055669  decreased coverage  0.0000746935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1262  30S ribosomal protein S4e  31.76 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00343319  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0243  30S ribosomal protein S4e  34.83 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0093  30S ribosomal protein S4e  33.33 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.507041 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0560  30S ribosomal protein S4e  30.67 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00212032 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1832  30S ribosomal protein S4e  32.59 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1716  30S ribosomal protein S4e  29.28 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.028053  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1396  30S ribosomal protein S4e  32.77 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1550  30S ribosomal protein S4e  29.78 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.199736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1747  30S ribosomal protein S4e  31.11 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.015598 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1730  30S ribosomal protein S4e  30.4 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.84836  decreased coverage  0.000360603 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0103  30S ribosomal protein S4e  30.3 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000259785  unclonable  0.000000558992 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1766  Ribosomal protein S4E, central domain protein  29.68 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17324  predicted protein  29.65 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04794  40S ribosomal protein S4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06840)  27.75 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06200  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 		 263 aa  98.6  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34143  ribosomal protein S4  29.47 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79556  predicted protein  29.47 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.116079 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18526  Ribosomal protein S4, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  28.36 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163807  normal  0.488363 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0798  30S ribosomal protein S4e  25.64 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>