34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0098 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0098  30S ribosomal protein S4e  100 
 
 		 235 aa  475  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00334877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0013  30S ribosomal protein S4e  63.25 
 
 		 236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000026774  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1716  30S ribosomal protein S4e  54.39 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.028053  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0722  30S ribosomal protein S4e  42.86 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0126662  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0656  30S ribosomal protein S4e  40.76 
 
 		 244 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0055669  decreased coverage  0.0000746935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1262  30S ribosomal protein S4e  40.76 
 
 		 244 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00343319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0167  30S ribosomal protein S4e  40.34 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000856142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1396  30S ribosomal protein S4e  44.12 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0454  30S ribosomal protein S4e  40.09 
 
 		 241 aa  180  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0061334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0222  Ribosomal protein S4E, central domain protein  41.33 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0576  30S ribosomal protein S4e  42.37 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.255322  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1509  Ribosomal protein S4E, central domain protein  41.05 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.86693e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2230  Ribosomal protein S4E, central domain protein  40.89 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2437  30S ribosomal protein S4e  38.84 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2241  30S ribosomal protein S4e  38.36 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000731595  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0544  30S ribosomal protein S4e  39.47 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211539  normal  0.284523 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0560  30S ribosomal protein S4e  40.25 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00212032 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0103  30S ribosomal protein S4e  39.17 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000259785  unclonable  0.000000558992 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0093  30S ribosomal protein S4e  36.29 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.507041 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2304  30S ribosomal protein S4e  39.82 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1730  30S ribosomal protein S4e  38.56 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.84836  decreased coverage  0.000360603 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1550  30S ribosomal protein S4e  34.32 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.199736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1840  Ribosomal protein S4E, central domain protein  35.8 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1766  Ribosomal protein S4E, central domain protein  36.13 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1747  30S ribosomal protein S4e  33.9 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.015598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1832  30S ribosomal protein S4e  32.34 
 
 		 237 aa  144  9e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0243  30S ribosomal protein S4e  34.6 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0798  30S ribosomal protein S4e  34.36 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04794  40S ribosomal protein S4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06840)  35.06 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18526  Ribosomal protein S4, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  31.47 
 
 		 253 aa  111  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163807  normal  0.488363 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79556  predicted protein  33.91 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.116079 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34143  ribosomal protein S4  33.91 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17324  predicted protein  31.9 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06200  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>