34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0798 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0798  30S ribosomal protein S4e  100 
 
 
238 aa  473  1e-132  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1716  30S ribosomal protein S4e  36.4 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.028053  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0560  30S ribosomal protein S4e  38.56 
 
 
238 aa  146  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00212032 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1730  30S ribosomal protein S4e  36.02 
 
 
238 aa  145  5e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.84836  decreased coverage  0.000360603 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1832  30S ribosomal protein S4e  31.03 
 
 
237 aa  141  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0098  30S ribosomal protein S4e  34.36 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00334877  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1550  30S ribosomal protein S4e  33.9 
 
 
238 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.199736  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0013  30S ribosomal protein S4e  35.68 
 
 
236 aa  135  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000026774  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1509  Ribosomal protein S4E, central domain protein  35.96 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.86693e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1747  30S ribosomal protein S4e  36.29 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.015598 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0103  30S ribosomal protein S4e  32.2 
 
 
241 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000259785  unclonable  0.000000558992 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0722  30S ribosomal protein S4e  31.05 
 
 
244 aa  125  7e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0126662  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1766  Ribosomal protein S4E, central domain protein  30.87 
 
 
239 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0656  30S ribosomal protein S4e  32.66 
 
 
244 aa  121  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0055669  decreased coverage  0.0000746935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1262  30S ribosomal protein S4e  32.26 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00343319  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0243  30S ribosomal protein S4e  29.39 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0167  30S ribosomal protein S4e  31.3 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000856142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2241  30S ribosomal protein S4e  30.17 
 
 
241 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000731595  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0454  30S ribosomal protein S4e  30.64 
 
 
241 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0061334  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18526  Ribosomal protein S4, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.16 
 
 
253 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163807  normal  0.488363 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1396  30S ribosomal protein S4e  32.93 
 
 
244 aa  102  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17324  predicted protein  34.18 
 
 
261 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0544  30S ribosomal protein S4e  30.6 
 
 
241 aa  98.6  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211539  normal  0.284523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2304  30S ribosomal protein S4e  28.21 
 
 
286 aa  92  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0576  30S ribosomal protein S4e  28.82 
 
 
242 aa  92  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.255322  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06200  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2437  30S ribosomal protein S4e  25.64 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34143  ribosomal protein S4  32.84 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2230  Ribosomal protein S4E, central domain protein  26.51 
 
 
233 aa  89.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79556  predicted protein  32.34 
 
 
262 aa  89.7  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.116079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0222  Ribosomal protein S4E, central domain protein  28.35 
 
 
235 aa  89.4  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0093  30S ribosomal protein S4e  26.29 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.507041 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1840  Ribosomal protein S4E, central domain protein  25.94 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04794  40S ribosomal protein S4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06840)  27.12 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>