34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2304 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2304  30S ribosomal protein S4e  100 
 
 		 286 aa  558  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1840  Ribosomal protein S4E, central domain protein  74.4 
 
 		 265 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2437  30S ribosomal protein S4e  69.23 
 
 		 240 aa  329  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2230  Ribosomal protein S4E, central domain protein  66.67 
 
 		 233 aa  322  6e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0222  Ribosomal protein S4E, central domain protein  65.95 
 
 		 235 aa  311  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2241  30S ribosomal protein S4e  37.6 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000731595  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0098  30S ribosomal protein S4e  40 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00334877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0013  30S ribosomal protein S4e  39.13 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000026774  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0544  30S ribosomal protein S4e  36.44 
 
 		 241 aa  155  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211539  normal  0.284523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0454  30S ribosomal protein S4e  33.88 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0061334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0167  30S ribosomal protein S4e  35.19 
 
 		 244 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0000856142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1509  Ribosomal protein S4E, central domain protein  35.84 
 
 		 236 aa  149  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  7.86693e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0656  30S ribosomal protein S4e  35.19 
 
 		 244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0055669  decreased coverage  0.0000746935 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1262  30S ribosomal protein S4e  34.76 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00343319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0722  30S ribosomal protein S4e  33.91 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0126662  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0243  30S ribosomal protein S4e  35.37 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0576  30S ribosomal protein S4e  36.02 
 
 		 242 aa  139  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.255322  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0560  30S ribosomal protein S4e  34.22 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00212032 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0093  30S ribosomal protein S4e  34.03 
 
 		 239 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.507041 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1716  30S ribosomal protein S4e  32.63 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.028053  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1396  30S ribosomal protein S4e  34.33 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1832  30S ribosomal protein S4e  32.81 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1730  30S ribosomal protein S4e  32.02 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.84836  decreased coverage  0.000360603 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0103  30S ribosomal protein S4e  32.34 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000259785  unclonable  0.000000558992 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1550  30S ribosomal protein S4e  30.84 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.199736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1747  30S ribosomal protein S4e  30.97 
 
 		 237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.015598 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18526  Ribosomal protein S4, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  30.54 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163807  normal  0.488363 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1766  Ribosomal protein S4E, central domain protein  26.94 
 
 		 239 aa  99.4  7e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79556  predicted protein  30.26 
 
 		 262 aa  98.6  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.116079 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34143  ribosomal protein S4  30.26 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17324  predicted protein  30.15 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04794  40S ribosomal protein S4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06840)  27.46 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06200  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0798  30S ribosomal protein S4e  28.21 
 
 		 238 aa  90.1  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>