28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3589 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3589  Protein of unknown function DUF1628  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0296  hypothetical protein  35.71 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.635456  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1429  Protein of unknown function DUF1628  28.77 
 
 
154 aa  58.2  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.747471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  37.86 
 
 
152 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1390  hypothetical protein  62.22 
 
 
177 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  27.89 
 
 
169 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  38.55 
 
 
131 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3311  Protein of unknown function DUF1628  33.72 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  31.53 
 
 
236 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  33.06 
 
 
128 aa  51.6  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  39.33 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0291  Protein of unknown function DUF1628  55.32 
 
 
176 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  47.62 
 
 
151 aa  48.5  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  40.54 
 
 
149 aa  48.5  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  39.19 
 
 
149 aa  48.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  46.3 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0791  Protein of unknown function DUF1628  37.65 
 
 
157 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  36 
 
 
124 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0297  hypothetical protein  38.27 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.497298  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  52.38 
 
 
128 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0792  Protein of unknown function DUF1628  32.95 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5010  hypothetical protein  45.28 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1532  hypothetical protein  36.84 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000205669  normal  0.0294417 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1250  hypothetical protein  40.74 
 
 
386 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.138271  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  38.33 
 
 
161 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2376  hypothetical protein  40.35 
 
 
271 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000807827  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  38.33 
 
 
169 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1635  Protein of unknown function DUF1628  37.35 
 
 
136 aa  41.6  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>