More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1430 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1430  ferredoxin  100 
 
 
113 aa  224  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1376  ferredoxin  83.93 
 
 
111 aa  185  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2779  ferredoxin  79.13 
 
 
115 aa  177  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.643117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0882  ferredoxin  85.11 
 
 
112 aa  168  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0891946  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3126  ferredoxin  76.79 
 
 
112 aa  167  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.60134  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  47.78 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  43.82 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  38.71 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  39.36 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  44.05 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  43.59 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  44.71 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  44.05 
 
 
101 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  43.59 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  39.36 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  38.82 
 
 
112 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  38.2 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  39.36 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09840  ferredoxin  34.94 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260552  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  38.89 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  40.74 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  35.48 
 
 
200 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  38.89 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  38.89 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  40 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.7 
 
 
342 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  37.36 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  36.96 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.71 
 
 
367 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  41.38 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  41.38 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  41.38 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.46 
 
 
344 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  38.71 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  38.71 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  39.08 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.74 
 
 
345 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.7 
 
 
335 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  34.52 
 
 
366 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.25 
 
 
338 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  34.12 
 
 
366 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1832  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.25 
 
 
339 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  36.71 
 
 
342 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  38.27 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  34.12 
 
 
366 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  36 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  34.62 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  40.7 
 
 
353 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.05 
 
 
342 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  37.08 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  34.62 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  34.62 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  38.03 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2756  ferredoxin  36.49 
 
 
339 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.624393  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  39.24 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.48 
 
 
341 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.53 
 
 
353 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.5 
 
 
354 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  38.2 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
349 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.73 
 
 
329 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  32.93 
 
 
366 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  39.08 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  35.71 
 
 
343 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  33.33 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.54 
 
 
358 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1567  putative flavodoxin oxidoreductase  35.16 
 
 
327 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.9 
 
 
348 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.73 
 
 
329 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.73 
 
 
329 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
343 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  34.62 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.15 
 
 
368 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.37 
 
 
366 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
343 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
343 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
349 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  40.85 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  35.58 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.37 
 
 
390 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
343 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.29 
 
 
331 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
343 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
343 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
343 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
343 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  39.44 
 
 
415 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.15 
 
 
366 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  37.78 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40 
 
 
352 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0377  ferredoxin  33.75 
 
 
350 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  36.59 
 
 
355 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  33.33 
 
 
394 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.33 
 
 
366 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  35.11 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  35.11 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.94 
 
 
375 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.76 
 
 
383 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  35.71 
 
 
122 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>