91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0042 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0012  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097362  normal  0.0784713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0007  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14007  tRNA-Met  95.74 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0236309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0046  tRNA-Met  95.74 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216228  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01505  tRNA-Met  93.02 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.946328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5028  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523947  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2610  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3195t  tRNA-Met  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1165  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1768  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000113481  hitchhiker  0.00809166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2193  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427584  hitchhiker  0.000000134605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2909  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000128307  hitchhiker  0.0000000000424074 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3218  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.409054  hitchhiker  0.0091644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3536  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00370417  hitchhiker  0.000000304392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1265  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276472  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2412  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00869744  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1601  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1177  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105973  hitchhiker  0.000000000000145149 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0011  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00653203  hitchhiker  0.000515394 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3363  tRNA-Met  85.96 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3658  tRNA-Met  85.96 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.458694  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0029  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0015  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5058  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  91.89 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4687  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00526927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4699  tRNA-Met  85.96 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5070  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0389718  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3403  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0080  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0819155  normal  0.0971338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0013  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.046309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0025  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00056  tRNA-Ile  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.366108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0017  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0140072  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21210  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0018  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.689825  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0615  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.294067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4382  tRNA-Met  85.96 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3898  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2796  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.466564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2264  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.716137  hitchhiker  0.00000000422113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3569  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3399  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143765  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3467  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3473  tRNA-Met  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.103015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t099  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0187022  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17540  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1863  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000158589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0015  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.099209  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1399  tRNA-Phe  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0008  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0007  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t023  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Met-1  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0011  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0832  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0622  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0012  tRNA-Met  89.58 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0594499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0008  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0120  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0737074  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0120  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000419542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0010  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.678705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0117  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000129359  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0032  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0772174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0668  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0011  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1714  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199477  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0025  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000863723  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2524  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0007  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2383  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0374  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0053  tRNA-Met  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1521  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0043  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0024  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00918004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0036  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0559117  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6046  tRNA-Met  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1788  tRNA-Met  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1362  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0038  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00268365  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0390  tRNA-Met  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0048  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  93.33 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0042  tRNA-Met  90.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.231974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>