More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0279 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0279  ribosomal protein S8  100 
 
 
136 aa  276  7e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000272421  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0277  30S ribosomal protein S8  51.11 
 
 
136 aa  140  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00362239  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf428  ribosomal protein S8  43.38 
 
 
137 aa  122  2e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2605  30S ribosomal protein S8  47.41 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000206402  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  44.12 
 
 
134 aa  117  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  44.12 
 
 
134 aa  117  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  44.85 
 
 
134 aa  117  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2804  30S ribosomal protein S8  45.93 
 
 
134 aa  116  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.804499  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  45.19 
 
 
133 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1263  30S ribosomal protein S8  45.19 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  45.19 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  42.22 
 
 
132 aa  115  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  47.41 
 
 
132 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  42.96 
 
 
132 aa  115  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  42.22 
 
 
132 aa  114  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  45.93 
 
 
131 aa  114  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  42.65 
 
 
134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  45.93 
 
 
134 aa  113  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  43.7 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  43.38 
 
 
132 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  43.7 
 
 
132 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  42.22 
 
 
132 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  43.7 
 
 
132 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1003  30S ribosomal protein S8  44.03 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000656681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  42.22 
 
 
132 aa  110  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1628  30S ribosomal protein S8  43.7 
 
 
132 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.569201  normal  0.282916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1339  30S ribosomal protein S8  44.44 
 
 
131 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  110  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  43.38 
 
 
134 aa  110  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  42.22 
 
 
131 aa  110  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  45.19 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  43.7 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  45.19 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0183  30S ribosomal protein S8  44.44 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.287486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2893  ribosomal protein S8  42.96 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  42.96 
 
 
133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0596  30S ribosomal protein S8  42.96 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3148  30S ribosomal protein S8  45.59 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.341893  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5056  30S ribosomal protein S8  43.7 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  40 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0781  30S ribosomal protein S8  45.93 
 
 
132 aa  108  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00525969  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  42.22 
 
 
132 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  40.74 
 
 
132 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  42.96 
 
 
132 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  43.7 
 
 
134 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  40 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0339  ribosomal protein S8  44.85 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1664  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0768138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1922  ribosomal protein S8  44.85 
 
 
131 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.688198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00952  30S ribosomal protein S8  44.03 
 
 
130 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  42.22 
 
 
135 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2204  ribosomal protein S8  43.38 
 
 
131 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184093  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  42.22 
 
 
133 aa  106  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  40.74 
 
 
131 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0682  30S ribosomal protein S8  44.44 
 
 
129 aa  106  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1444  30S ribosomal protein S8  40.74 
 
 
132 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.18582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1853  30S ribosomal protein S8  42.22 
 
 
133 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.923356 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  42.22 
 
 
132 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1781  SSU ribosomal protein S8P  42.54 
 
 
132 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0284489  normal  0.0855864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1346  30S ribosomal protein S8  40.74 
 
 
132 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000055965  normal  0.0735318 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  40.74 
 
 
130 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0268  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
130 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0501606  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0491  ribosomal protein S8  40 
 
 
131 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.263273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0773  30S ribosomal protein S8  42.22 
 
 
132 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590694  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  40.74 
 
 
131 aa  105  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0419  30S ribosomal protein S8  44.03 
 
 
130 aa  104  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000465732  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  42.22 
 
 
130 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  40 
 
 
132 aa  104  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  37.78 
 
 
132 aa  104  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  41.3 
 
 
135 aa  104  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  41.48 
 
 
133 aa  105  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1000  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361404  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  40 
 
 
132 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  37.78 
 
 
132 aa  104  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0605  30S ribosomal protein S8  40.74 
 
 
130 aa  104  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354431  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  40.74 
 
 
133 aa  104  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1378  30S ribosomal protein S8  41.48 
 
 
132 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.62644  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  40.74 
 
 
132 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1559  30S ribosomal protein S8  40 
 
 
132 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1855  30S ribosomal protein S8  42.22 
 
 
132 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3434  30S ribosomal protein S8  40.74 
 
 
132 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133502  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0861  SSU ribosomal protein S8P  42.22 
 
 
132 aa  103  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118067  hitchhiker  0.00176948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2150  ribosomal protein S8  41.18 
 
 
131 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  42.96 
 
 
132 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  42.96 
 
 
131 aa  102  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3653  30S ribosomal protein S8  40.74 
 
 
132 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3987  30S ribosomal protein S8  41.79 
 
 
130 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0073999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>